SMPD3

SMPD3
Ідентифікатори
Символи	SMPD3, NSMASE2, sphingomyelin phosphodiesterase 3
Зовнішні ІД	OMIM: 605777 MGI: 1927578 HomoloGene: 10260 GeneCards: SMPD3
Онтологія гена
Молекулярна функція	• sphingomyelin phosphodiesterase activity; • зв'язування з іоном металу; • hydrolase activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • neutral sphingomyelin phosphodiesterase activity; • phospholipase activity;
Клітинна компонента	• комплекс Ґольджі; • мембрана; • Golgi membrane; • Golgi cis cisterna; • клітинна мембрана; • цитоплазма;
Біологічний процес	• positive regulation of ceramide biosynthetic process; • lipid metabolism; • multicellular organism development; • sphingomyelin catabolic process; • peptide hormone secretion; • hematopoietic progenitor cell differentiation; • клітинний цикл; • positive regulation of exosomal secretion; • sphingomyelin metabolic process; • sphingolipid metabolic process; • skeletal system development; • осифікація ендохондральна; • chondrocyte development; • regulation of leukocyte migration; • bone mineralization; • BMP signaling pathway; • multicellular organism growth; • protein kinase B signaling; • cartilage development; • protein homooligomerization; • bone development; • regulation of cartilage development; • cellular response to redox state; • bone growth; • cellular response to peptide; • осифікація; • regulation of protein phosphorylation; • chondrocyte development involved in endochondral bone morphogenesis; • ceramide metabolic process; • glycosphingolipid metabolic process; • GO:0072468 сигнальна трансдукція; • polysaccharide transport; • lung development; • collagen metabolic process; • GO:0072353 cellular response to reactive oxygen species; • positive regulation of mitotic nuclear division; • platelet-derived growth factor receptor signaling pathway; • lung alveolus development; • positive regulation of smooth muscle cell proliferation; • respiratory system development; • cellular response to hydrogen peroxide; • G1 to G0 transition; • cellular response to magnesium ion; • cellular response to tumor necrosis factor; • DNA biosynthetic process; • extracellular matrix assembly; • sphingolipid mediated signaling pathway; • dentinogenesis; • mitotic nuclear division; • cellular response to oxidised low-density lipoprotein particle stimulus; • regulation of hyaluronan biosynthetic process; • negative regulation of hyaluronan biosynthetic process;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	55512
	58994
	ENSG00000103056
	ENSMUSG00000031906
	Q9NY59
	Q9JJY3
	NM_018667
	NM_021491
	NP_061137
	NP_067466
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SMPD3 (англ. Sphingomyelin phosphodiesterase 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 655 амінокислот, а молекулярна маса — 71 081^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MVLYTTPFPN	SCLSALHCVS	WALIFPCYWL	VDRLAASFIP	TTYEKRQRAD
DPCCLQLLCT	ALFTPIYLAL	LVASLPFAFL	GFLFWSPLQS	ARRPYIYSRL
EDKGLAGGAA	LLSEWKGTGP	GKSFCFATAN	VCLLPDSLAR	VNNLFNTQAR
AKEIGQRIRN	GAARPQIKIY	IDSPTNTSIS	AASFSSLVSP	QGGDGVARAV
PGSIKRTASV	EYKGDGGRHP	GDEAANGPAS	GDPVDSSSPE	DACIVRIGGE
EGGRPPEADD	PVPGGQARNG	AGGGPRGQTP	NHNQQDGDSG	SLGSPSASRE
SLVKGRAGPD	TSASGEPGAN	SKLLYKASVV	KKAAARRRRH	PDEAFDHEVS
AFFPANLDFL	CLQEVFDKRA	ATKLKEQLHG	YFEYILYDVG	VYGCQGCCSF
KCLNSGLLFA	SRYPIMDVAY	HCYPNKCNDD	ALASKGALFL	KVQVGSTPQD
QRIVGYIACT	HLHAPQEDSA	IRCGQLDLLQ	DWLADFRKST	SSSSAANPEE
LVAFDVVCGD	FNFDNCSSDD	KLEQQHSLFT	HYRDPCRLGP	GEEKPWAIGT
LLDTNGLYDE	DVCTPDNLQK	VLESEEGRRE	YLAFPTSKSS	GQKGRKELLK
GNGRRIDYML	HAEEGLCPDW	KAEVEEFSFI	TQLSGLTDHL	PVAMRLMVSS
GEEEA

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як метаболізм ліпідів, клітинний цикл, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном магнію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, апараті гольджі.

Література

Hofmann K., Tomiuk S., Wolff G., Stoffel W. (2000). Cloning and characterization of the mammalian brain-specific, Mg2+-dependent neutral sphingomyelinase. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 97: 5895—5900. PMID 10823942 DOI:10.1073/pnas.97.11.5895
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Miura Y., Gotoh E., Nara F., Nishijima M., Hanada K. (2004). Hydrolysis of sphingosylphosphocholine by neutral sphingomyelinases. FEBS Lett. 557: 288—292. PMID 14741383 DOI:10.1016/S0014-5793(03)01523-0
Tani M., Hannun Y.A. (2007). Analysis of membrane topology of neutral sphingomyelinase 2. FEBS Lett. 581: 1323—1328. PMID 17349629 DOI:10.1016/j.febslet.2007.02.046

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14240 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9NY59 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 16

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14240 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q9NY59 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

SMPD3

Література

Примітки

Див. також

Навігаційне меню

Пошук