SMUG1

SMUG1
Ідентифікатори
Символи	SMUG1, FDG, HMUDG, UNG3, single-strand-selective monofunctional uracil-DNA glycosylase 1
Зовнішні ІД	OMIM: 607753 MGI: 1918976 HomoloGene: 8629 GeneCards: SMUG1
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • uracil DNA N-glycosylase activity • DNA N-glycosylase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • oxidized pyrimidine nucleobase lesion DNA N-glycosylase activity • hydrolase activity • single-strand selective uracil DNA N-glycosylase activity Клітинна компонента • ядерце • клітинне ядро • нуклеоплазма Біологічний процес • depyrimidination • cellular response to DNA damage stimulus • base-excision repair • GO:0100026 Репарація ДНК Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23583	71726
Ensembl	ENSG00000123415	ENSMUSG00000036061
UniProt	Q53HV7	Q6P5C5
RefSeq (мРНК)	NM_001243787 NM_001243788 NM_001243789 NM_001243790 NM_001243791 NM_014311	NM_027885
RefSeq (білок)	NP_001230716 NP_001230717 NP_001230718 NP_001230719 NP_001230720 NP_055126 NP_001338166 NP_001338167 NP_001338168 NP_001338169 NP_001338170 NP_001338171 NP_001338172 NP_001338173 NP_001338174 NP_001338175 NP_001338176 NP_001338177 NP_001338178 NP_001338179 NP_001338180 NP_001338181 NP_001338182 NP_001338183 NP_001338184 NP_001338185 NP_001338186 NP_001338187 NP_001338188 NP_001338189 NP_001338190 NP_001338191	NP_082161
Локус (UCSC)	н/д	Хр. 15: 103.06 – 103.08 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SMUG1 (англ. Single-strand-selective monofunctional uracil-DNA glycosylase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 270 амінокислот, а молекулярна маса — 29 862.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPQAFLLGSI		HEPAGALMEP		QPCPGSLAES		FLEEELRLNA		ELSQLQFSEP
VGIIYNPVEY		AWEPHRNYVT		RYCQGPKEVL		FLGMNPGPFG		MAQTGVPFGE
VSMVRDWLGI		VGPVLTPPQE		HPKRPVLGLE		CPQSEVSGAR		FWGFFRNLCG
QPEVFFHHCF		VHNLCPLLFL		APSGRNLTPA		ELPAKQREQL		LGICDAALCR
QVQLLGVRLV		VGVGRLAEQR		ARRALAGLMP		EVQVEGLLHP		SPRNPQANKG
WEAVAKERLN		ELGLLPLLLK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до гідролаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, репарація ДНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Haushalter K.A., Stukenberg P.T., Kirschner M.W., Verdine G.L. (1999). Identification of a new uracil-DNA glycosylase family by expression cloning using synthetic inhibitors. Curr. Biol. 9: 174—185. PMID 10074426 DOI:10.1016/S0960-9822(99)80087-6
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 12