SNAI1

SNAI1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2Y48, 3W5K, 4QLI
Ідентифікатори
Символи	SNAI1, SLUGH2, SNA, SNAH, SNAIL, SNAIL1, dJ710H13.1, snail family zinc finger 1, snail family transcriptional repressor 1
Зовнішні ІД	OMIM: 604238 MGI: 98330 HomoloGene: 4363 GeneCards: SNAI1
Онтологія гена Молекулярна функція • sequence-specific DNA binding • DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • зв'язування з іоном металу • kinase binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • E-box binding Клітинна компонента • клітинне ядро • цитоплазма • нуклеоплазма • pericentric heterochromatin • гіалоплазма Біологічний процес • trophoblast giant cell differentiation • roof of mouth development • regulation of bicellular tight junction assembly • positive regulation of cell migration • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • epithelial to mesenchymal transition involved in endocardial cushion formation • negative regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage • multicellular organism development • negative regulation of vitamin D biosynthetic process • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator • osteoblast differentiation • negative regulation of cell differentiation involved in embryonic placenta development • cartilage morphogenesis • hair follicle morphogenesis • left/right pattern formation • mesoderm development • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • cell migration • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • Notch signaling involved in heart development • mesoderm formation • Епітеліально-мезенхімальний перехід • positive regulation of epithelial to mesenchymal transition • heterochromatin organization • aortic valve morphogenesis Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6615	20613
Ensembl	ENSG00000124216	ENSMUSG00000042821
UniProt	O95863	Q02085
RefSeq (мРНК)	NM_005985	NM_011427
RefSeq (білок)	NP_005976	NP_035557
Локус (UCSC)	Хр. 20: 49.98 – 49.99 Mb	Хр. 2: 167.38 – 167.38 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SNAI1 (англ. Snail family transcriptional repressor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 264 амінокислот, а молекулярна маса — 29 083.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPRSFLVRKP		SDPNRKPNYS		ELQDSNPEFT		FQQPYDQAHL		LAAIPPPEIL
NPTASLPMLI		WDSVLAPQAQ		PIAWASLRLQ		ESPRVAELTS		LSDEDSGKGS
QPPSPPSPAP		SSFSSTSVSS		LEAEAYAAFP		GLGQVPKQLA		QLSEAKDLQA
RKAFNCKYCN		KEYLSLGALK		MHIRSHTLPC		VCGTCGKAFS		RPWLLQGHVR
THTGEKPFSC		PHCSRAFADR		SNLRAHLQTH		SDVKKYQCQA		CARTFSRMSL
LHKHQESGCS		GCPR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Twigg S.R., Wilkie A.O.M. (1999). Characterisation of the human snail (SNAI1) gene and exclusion as a major disease gene in craniosynostosis. Hum. Genet. 105: 320—326. PMID 10543399 DOI:10.1007/s004399900143
• Paznekas W.A., Okajima K., Schertzer M., Wood S., Jabs E.W. (1999). Genomic organization, expression, and chromosome location of the human SNAIL gene (SNAI1) and a related processed pseudogene (SNAI1P). Genomics. 62: 42—49. PMID 10585766 DOI:10.1006/geno.1999.6010
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Yook J.I., Li X.Y., Ota I., Fearon E.R., Weiss S.J. (2005). Wnt-dependent regulation of the E-cadherin repressor snail. J. Biol. Chem. 280: 11740—11748. PMID 15647282 DOI:10.1074/jbc.M413878200
• Mingot J.M., Vega S., Maestro B., Sanz J.M., Nieto M.A. (2009). Characterization of Snail nuclear import pathways as representatives of C2H2 zinc finger transcription factors. J. Cell Sci. 122: 1452—1460. PMID 19386897 DOI:10.1242/jcs.041749
• Lim S.O., Kim H., Jung G. (2010). p53 inhibits tumor cell invasion via the degradation of snail protein in hepatocellular carcinoma. FEBS Lett. 584: 2231—2236. PMID 20385133 DOI:10.1016/j.febslet.2010.04.006

Див. також

• Хромосома 20