SNRNP200
Перейти до навігації
Перейти до пошуку
SNRNP200 (англ. Small nuclear ribonucleoprotein U5 subunit 200) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 136 амінокислот, а молекулярна маса — 244 508[5].
Послідовність амінокислот
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MADVTARSLQ | YEYKANSNLV | LQADRSLIDR | TRRDEPTGEV | LSLVGKLEGT | ||||
RMGDKAQRTK | PQMQEERRAK | RRKRDEDRHD | INKMKGYTLL | SEGIDEMVGI | ||||
IYKPKTKETR | ETYEVLLSFI | QAALGDQPRD | ILCGAADEVL | AVLKNEKLRD | ||||
KERRKEIDLL | LGQTDDTRYH | VLVNLGKKIT | DYGGDKEIQN | MDDNIDETYG | ||||
VNVQFESDEE | EGDEDVYGEV | REEASDDDME | GDEAVVRCTL | SANLVASGEL | ||||
MSSKKKDLHP | RDIDAFWLQR | QLSRFYDDAI | VSQKKADEVL | EILKTASDDR | ||||
ECENQLVLLL | GFNTFDFIKV | LRQHRMMILY | CTLLASAQSE | AEKERIMGKM | ||||
EADPELSKFL | YQLHETEKED | LIREERSRRE | RVRQSRMDTD | LETMDLDQGG | ||||
EALAPRQVLD | LEDLVFTQGS | HFMANKRCQL | PDGSFRRQRK | GYEEVHVPAL | ||||
KPKPFGSEEQ | LLPVEKLPKY | AQAGFEGFKT | LNRIQSKLYR | AALETDENLL | ||||
LCAPTGAGKT | NVALMCMLRE | IGKHINMDGT | INVDDFKIIY | IAPMRSLVQE | ||||
MVGSFGKRLA | TYGITVAELT | GDHQLCKEEI | SATQIIVCTP | EKWDIITRKG | ||||
GERTYTQLVR | LIILDEIHLL | HDDRGPVLEA | LVARAIRNIE | MTQEDVRLIG | ||||
LSATLPNYED | VATFLRVDPA | KGLFYFDNSF | RPVPLEQTYV | GITEKKAIKR | ||||
FQIMNEIVYE | KIMEHAGKNQ | VLVFVHSRKE | TGKTARAIRD | MCLEKDTLGL | ||||
FLREGSASTE | VLRTEAEQCK | NLELKDLLPY | GFAIHHAGMT | RVDRTLVEDL | ||||
FADKHIQVLV | STATLAWGVN | LPAHTVIIKG | TQVYSPEKGR | WTELGALDIL | ||||
QMLGRAGRPQ | YDTKGEGILI | TSHGELQYYL | SLLNQQLPIE | SQMVSKLPDM | ||||
LNAEIVLGNV | QNAKDAVNWL | GYAYLYIRML | RSPTLYGISH | DDLKGDPLLD | ||||
QRRLDLVHTA | ALMLDKNNLV | KYDKKTGNFQ | VTELGRIASH | YYITNDTVQT | ||||
YNQLLKPTLS | EIELFRVFSL | SSEFKNITVR | EEEKLELQKL | LERVPIPVKE | ||||
SIEEPSAKIN | VLLQAFISQL | KLEGFALMAD | MVYVTQSAGR | LMRAIFEIVL | ||||
NRGWAQLTDK | TLNLCKMIDK | RMWQSMCPLR | QFRKLPEEVV | KKIEKKNFPF | ||||
ERLYDLNHNE | IGELIRMPKM | GKTIHKYVHL | FPKLELSVHL | QPITRSTLKV | ||||
ELTITPDFQW | DEKVHGSSEA | FWILVEDVDS | EVILHHEYFL | LKAKYAQDEH | ||||
LITFFVPVFE | PLPPQYFIRV | VSDRWLSCET | QLPVSFRHLI | LPEKYPPPTE | ||||
LLDLQPLPVS | ALRNSAFESL | YQDKFPFFNP | IQTQVFNTVY | NSDDNVFVGA | ||||
PTGSGKTICA | EFAILRMLLQ | SSEGRCVYIT | PMEALAEQVY | MDWYEKFQDR | ||||
LNKKVVLLTG | ETSTDLKLLG | KGNIIISTPE | KWDILSRRWK | QRKNVQNINL | ||||
FVVDEVHLIG | GENGPVLEVI | CSRMRYISSQ | IERPIRIVAL | SSSLSNAKDV | ||||
AHWLGCSATS | TFNFHPNVRP | VPLELHIQGF | NISHTQTRLL | SMAKPVYHAI | ||||
TKHSPKKPVI | VFVPSRKQTR | LTAIDILTTC | AADIQRQRFL | HCTEKDLIPY | ||||
LEKLSDSTLK | ETLLNGVGYL | HEGLSPMERR | LVEQLFSSGA | IQVVVASRSL | ||||
CWGMNVAAHL | VIIMDTQYYN | GKIHAYVDYP | IYDVLQMVGH | ANRPLQDDEG | ||||
RCVIMCQGSK | KDFFKKFLYE | PLPVESHLDH | CMHDHFNAEI | VTKTIENKQD | ||||
AVDYLTWTFL | YRRMTQNPNY | YNLQGISHRH | LSDHLSELVE | QTLSDLEQSK | ||||
CISIEDEMDV | APLNLGMIAA | YYYINYTTIE | LFSMSLNAKT | KVRGLIEIIS | ||||
NAAEYENIPI | RHHEDNLLRQ | LAQKVPHKLN | NPKFNDPHVK | TNLLLQAHLS | ||||
RMQLSAELQS | DTEEILSKAI | RLIQACVDVL | SSNGWLSPAL | AAMELAQMVT | ||||
QAMWSKDSYL | KQLPHFTSEH | IKRCTDKGVE | SVFDIMEMED | EERNALLQLT | ||||
DSQIADVARF | CNRYPNIELS | YEVVDKDSIR | SGGPVVVLVQ | LEREEEVTGP | ||||
VIAPLFPQKR | EEGWWVVIGD | AKSNSLISIK | RLTLQQKAKV | KLDFVAPATG | ||||
AHNYTLYFMS | DAYMGCDQEY | KFSVDVKEAE | TDSDSD |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ. Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у ядрі.
- Liu S., Rauhut R., Vornlocher H.-P., Luehrmann R. (2006). The network of protein-protein interactions within the human U4/U6.U5 tri-snRNP. RNA. 12: 1418—1430. PMID 16723661 DOI:10.1261/rna.55406
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Laggerbauer B., Achsel T., Luehrmann R. (1998). The human U5-200kD DEXH-box protein unwinds U4/U6 RNA duplices in vitro. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 95: 4188—4192. PMID 9539711 DOI:10.1073/pnas.95.8.4188
- Jurica M.S., Licklider L.J., Gygi S.P., Grigorieff N., Moore M.J. (2002). Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis. RNA. 8: 426—439. PMID 11991638 DOI:10.1017/S1355838202021088
- Carrascal M., Ovelleiro D., Casas V., Gay M., Abian J. (2008). Phosphorylation analysis of primary human T lymphocytes using sequential IMAC and titanium oxide enrichment. J. Proteome Res. 7: 5167—5176. PMID 19367720 DOI:10.1021/pr800500r
- Li N., Mei H., MacDonald I.M., Jiao X., Hejtmancik J.F. (2010). Mutations in ASCC3L1 on 2q11.2 are associated with autosomal dominant retinitis pigmentosa in a Chinese family. Invest. Ophthalmol. Vis. Sci. 51: 1036—1043. PMID 19710410 DOI:10.1167/iovs.09-3725
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з SNRNP200 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30859 (англ.) . Архів оригіналу за 7 квітня 2016. Процитовано 6 лютого 2017.
- ↑ UniProt, O75643 (англ.) . Архів оригіналу за 23 листопада 2016. Процитовано 6 лютого 2017.
Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |