SNRNP48

SNRNP48
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2VY4, 2VY5
Ідентифікатори
Символи	SNRNP48, C6orf151, dJ336K20B.1, dJ512B11.2, small nuclear ribonucleoprotein U11/U12 subunit 48
Зовнішні ІД	MGI: 1915047 HomoloGene: 12191 GeneCards: SNRNP48
Онтологія гена Молекулярна функція • зв'язування з іоном металу Клітинна компонента • клітинне ядро • spliceosomal complex • U12-type spliceosomal complex • нуклеоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • mRNA splicing, via spliceosome • mRNA processing • Сплайсинг РНК Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	154007	67797
Ensembl	ENSG00000168566	ENSMUSG00000021431
UniProt	Q6IEG0	Q9D361
RefSeq (мРНК)	NM_152551	NM_026382
RefSeq (білок)	NP_689764	NP_080658
Локус (UCSC)	Хр. 6: 7.59 – 7.61 Mb	Хр. 13: 38.39 – 38.41 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SNRNP48 (англ. Small nuclear ribonucleoprotein U11/U12 subunit 48) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 6-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 339 амінокислот, а молекулярна маса — 39 965.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEGEPPPVEE		RRRLQEELNE		FVESGCRTLE		EVTASLGWDL		DSLDPGEEEA
AEDEVVICPY		DSNHHMPKSS		LAKHMASCRL		RKMGYTKEEE		DEMYNPEFFY
ENVKIPSITL		NKDSQFQIIK		QARTAVGKDS		DCYNQRIYSS		LPVEVPLNHK
RFVCDLTQAD		RLALYDFVVE		ETKKKRSDSQ		IIENDSDLFV		DLAAKINQDN
SRKSPKSYLE		ILAEVRDYKR		RRQSYRAKNV		HITKKSYTEV		IRDVINVHME
ELSNHWQEEQ		EKAEDDAEKN		EERRSASVDS		RQSGGSYLDA		ECSRHRRDRS
RSPHKRKRNK		DKDKNCESRR		RKERDGERHH		SHKRRKQKI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Andreeva A., Tidow H. (2008). A novel CHHC Zn-finger domain found in spliceosomal proteins and tRNA modifying enzymes. Bioinformatics. 24: 2277—2280. PMID 18703587 DOI:10.1093/bioinformatics/btn431
• Tidow H., Andreeva A., Rutherford T.J., Fersht A.R. (2009). Solution structure of the U11-48K CHHC zinc-finger domain that specifically binds the 5' splice site of U12-type introns. Structure. 17: 294—302. PMID 19217400 DOI:10.1016/j.str.2008.11.013

Див. також

• Хромосома 6