SNRPA

SNRPA
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1AUD, 1DRZ, 1DZ5, 1FHT, 1M5K, 1M5O, 1M5P, 1M5V, 1NU4, 1OIA, 1SJ3, 1SJ4, 1SJF, 1U6B, 1URN, 1VBX, 1VBY, 1VBZ, 1VC0, 1VC5, 1VC6, 1ZZN, 2A3J, 2NZ4, 2OIH, 2OJ3, 2U1A, 3BO2, 3BO3, 3BO4, 3CUL, 3CUN, 3EGZ, 3G8S, 3G8T, 3G96, 3G9C, 3HHN, 3IIN, 3IRW, 3IWN, 3K0J, 3L3C, 3MUM, 3MUR, 3MUT, 3MUV, 3MXH, 3P49, 3PGW, 3R1H, 3R1L, 3UCU, 3UCZ, 3UD3, 3UD4, 4C4W, 4PR6, 4PRF, 4W90, 4YB1, 5DDO, 5DDR, 5DDQ, 5DDP, 5FJ4
Ідентифікатори
Символи	SNRPA, Mud1, U1-A, U1A, Small nuclear ribonucleoprotein polypeptide A
Зовнішні ІД	OMIM: 182285 HomoloGene: 3380 GeneCards: SNRPA
Онтологія гена Молекулярна функція • U1 snRNA binding • snRNA stem-loop binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • nucleic acid binding • U1 snRNP binding • identical protein binding Клітинна компонента • spliceosomal complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • U1 snRNP Біологічний процес • mRNA processing • regulation of mRNA polyadenylation • Сплайсинг РНК • mRNA splicing, via spliceosome Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6626	292729
Ensembl	ENSG00000077312	ENSRNOG00000001501
UniProt	P09012	Q5U214
RefSeq (мРНК)	NM_004596	NM_001008303
RefSeq (білок)	NP_004587	NP_001008304
Локус (UCSC)	Хр. 19: 40.75 – 40.77 Mb	н/д
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SNRPA (англ. Small nuclear ribonucleoprotein polypeptide A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 282 амінокислот, а молекулярна маса — 31 280.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAVPETRPNH		TIYINNLNEK		IKKDELKKSL		YAIFSQFGQI		LDILVSRSLK
MRGQAFVIFK		EVSSATNALR		SMQGFPFYDK		PMRIQYAKTD		SDIIAKMKGT
FVERDRKREK		RKPKSQETPA		TKKAVQGGGA		TPVVGAVQGP		VPGMPPMTQA
PRIMHHMPGQ		PPYMPPPGMI		PPPGLAPGQI		PPGAMPPQQL		MPGQMPPAQP
LSENPPNHIL		FLTNLPEETN		ELMLSMLFNQ		FPGFKEVRLV		PGRHDIAFVE
FDNEVQAGAA		RDALQGFKIT		QNNAMKISFA		KK

A: Аланін
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рибонуклеопротеїнів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Nelissen R.L.H., Sillekens P.T.G., Beijer R.P., Geurts van Kessel A.H.M., van Venrooij W.J. (1991). Structure, chromosomal localization and evolutionary conservation of the gene encoding human U1 snRNP-specific A protein. Gene. 102: 189—196. PMID 1831431 DOI:10.1016/0378-1119(91)90077-O
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Lutz C.S., Cooke C., O'Connor J.P., Kobayashi R., Alwine J.C. (1998). The snRNP-free U1A (SF-A) complex(es): identification of the largest subunit as PSF, the polypyrimidine-tract binding protein-associated splicing factor. RNA. 4: 1493—1499. PMID 9848648 DOI:10.1017/S1355838298981183
• Nagai K., Oubridge C., Jessen T.-H., Li J., Evans P.R. (1990). Crystal structure of the RNA-binding domain of the U1 small nuclear ribonucleoprotein A. Nature. 348: 515—520. PMID 2147232 DOI:10.1038/348515a0
• Oubridge C., Ito N., Evans P.R., Teo C.-H., Nagai K. (1994). Crystal structure at 1.92-A resolution of the RNA-binding domain of the U1A spliceosomal protein complexed with an RNA hairpin. Nature. 372: 432—438. PMID 7984237 DOI:10.1038/372432a0
• Hoffman D.W., Query C.C., Golden B.L., White S.W., Keene J.D. (1991). RNA-binding domain of the A protein component of the U1 small nuclear ribonucleoprotein analyzed by NMR spectroscopy is structurally similar to ribosomal proteins. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 88: 2495—2499. PMID 1826055 DOI:10.1073/pnas.88.6.2495

Див. також

• Хромосома 19