SNRPC

SNRPC
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2VRD, 3CW1, 4PJO
Ідентифікатори
Символи	SNRPC, U1C, Yhc1, Small nuclear ribonucleoprotein polypeptide C
Зовнішні ІД	OMIM: 603522 MGI: 109489 HomoloGene: 136764 GeneCards: SNRPC
Онтологія гена Молекулярна функція • protein homodimerization activity • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • single-stranded RNA binding • nucleic acid binding • U1 snRNA binding • pre-mRNA 5'-splice site binding • U1 snRNP binding • RNA binding • mRNA binding Клітинна компонента • Тільце Кахаля • prespliceosome • U1 snRNP • клітинне ядро • commitment complex • нуклеоплазма • U2-type prespliceosome Біологічний процес • spliceosomal snRNP assembly • mRNA 5'-splice site recognition • mRNA splicing, via spliceosome Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6631	20630
Ensembl	ENSG00000124562	ENSMUSG00000024217
UniProt	P09234	Q62241
RefSeq (мРНК)	NM_003093	NM_011432
RefSeq (білок)	NP_003084	NP_035562
Локус (UCSC)	Хр. 6: 34.76 – 34.77 Mb	Хр. 17: 28.06 – 28.07 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SNRPC (англ. Small nuclear ribonucleoprotein polypeptide C) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 159 амінокислот, а молекулярна маса — 17 394.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPKFYCDYCD		TYLTHDSPSV		RKTHCSGRKH		KENVKDYYQK		WMEEQAQSLI
DKTTAAFQQG		KIPPTPFSAP		PPAGAMIPPP		PSLPGPPRPG		MMPAPHMGGP
PMMPMMGPPP		PGMMPVGPAP		GMRPPMGGHM		PMMPGPPMMR		PPARPMMVPT
RPGMTRPDR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рибонуклеопротеїнів, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, РНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Sillekens P.T.G., Beijer R.P., Habets W.J., van Venrooij W.J. (1988). Human U1 snRNP-specific C protein: complete cDNA and protein sequence and identification of a multigene family in mammals. Nucleic Acids Res. 16: 8307—8321. PMID 2971157 DOI:10.1093/nar/16.17.8307
• Heinrichs V., Bach M., Winkelmann G., Luehrmann R. (1990). U1-specific protein C needed for efficient complex formation of U1 snRNP with a 5' splice site. Science. 247: 69—72. PMID 2136774 DOI:10.1126/science.2136774
• Pomeranz Krummel D.A., Oubridge C., Leung A.K., Li J., Nagai K. (2009). Crystal structure of human spliceosomal U1 snRNP at 5.5 A resolution. Nature. 458: 475—480. PMID 19325628 DOI:10.1038/nature07851

Див. також

• Хромосома 6