SNX3

SNX3
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2YPS, 2MXC
Ідентифікатори
Символи	SNX3, Grd19, MCOPS8, SDP3, sorting nexin 3
Зовнішні ІД	OMIM: 605930 MGI: 1860188 HomoloGene: 36144 GeneCards: SNX3
Онтологія гена Молекулярна функція • phosphatidylinositol-3-phosphate binding • phosphatidylinositol-3,5-bisphosphate binding • phosphatidylinositol-4-phosphate binding • phosphatidylinositol-5-phosphate binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • phosphatidylinositol binding • protein phosphatase binding • lipid binding • phosphatidylinositol phosphate binding Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • ендосома • early endosome membrane • early phagosome • retromer complex • early endosome • phagocytic vesicle • екзосома • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • clathrin-coated vesicle • extrinsic component of membrane • endosome membrane Біологічний процес • protein to membrane docking • negative regulation of viral entry into host cell • negative regulation of phagocytosis • response to bacterium • GO:1903363 negative regulation of protein catabolic process • negative regulation of early endosome to late endosome transport • membrane invagination • regulation of Wnt signaling pathway • intralumenal vesicle formation • negative regulation of protein transport • positive regulation of neuron projection development • protein transport • Wnt signaling pathway • protein deubiquitination • GO:0015915 транспорт Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8724	54198
Ensembl	ENSG00000112335	ENSMUSG00000019804
UniProt	O60493	O70492
RefSeq (мРНК)	NM_152828 NM_001300928 NM_001300929 NM_003795 NM_152827	NM_017472
RefSeq (білок)	NP_001287857 NP_001287858 NP_003786 NP_690040	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 6: 108.21 – 108.26 Mb	Хр. 10: 42.38 – 42.41 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SNX3 (англ. Sorting nexin 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 162 амінокислот, а молекулярна маса — 18 762.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAETVADTRR		LITKPQNLND		AYGPPSNFLE		IDVSNPQTVG		VGRGRFTTYE
IRVKTNLPIF		KLKESTVRRR		YSDFEWLRSE		LERESKVVVP		PLPGKAFLRQ
LPFRGDDGIF		DDNFIEERKQ		GLEQFINKVA		GHPLAQNERC		LHMFLQDEII
DKSYTPSKIR		HA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ліпідами. Локалізований у цитоплазматичних везикулах, ендосомах.

Література

• Haft C.R., de la Luz Sierra M., Barr V.A., Haft D.H., Taylor S.I. (1998). Identification of a family of sorting nexin molecules and characterization of their association with receptors. Mol. Cell. Biol. 18: 7278—7287. PMID 9819414 DOI:10.1128/MCB.18.12.7278
• Xu Y., Hortsman H., Seet L., Wong S.H., Hong W. (2001). SNX3 regulates endosomal function through its PX-domain-mediated interaction with PtdIns(3)P. Nat. Cell Biol. 3: 658—666. PMID 11433298 DOI:10.1038/35083051
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Chua R.Y., Wong S.H. (2013). SNX3 recruits to phagosomes and negatively regulates phagocytosis in dendritic cells. Immunology. 139: 30—47. PMID 23237080 DOI:10.1111/imm.12051

Див. також

• Хромосома 6