SNX5

SNX5
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1SYS
Ідентифікатори
Символи	SNX5, sorting nexin 5
Зовнішні ІД	OMIM: 605937 MGI: 1916428 HomoloGene: 40944 GeneCards: SNX5
Онтологія гена Молекулярна функція • dynactin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • phosphatidylinositol binding • protein heterodimerization activity • lipid binding • cadherin binding • phosphatidylinositol-5-phosphate binding • D1 dopamine receptor binding • phosphatidylinositol-4-phosphate binding • phosphatidylinositol-3,5-bisphosphate binding Клітинна компонента • цитоплазма • ендосома • cell projection • early endosome membrane • retromer, tubulation complex • мембрана • ruffle • extrinsic component of cytoplasmic side of plasma membrane • клітинна мембрана • extrinsic component of endosome membrane • tubular endosome • retromer complex • early endosome • phagocytic cup • cytoplasmic vesicle membrane • macropinocytic cup • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • гіалоплазма • brush border • внутрішньоклітинний Біологічний процес • ендоцитоз • vesicle organization • retrograde transport, endosome to Golgi • protein transport • Піноцитоз • intracellular protein transport • regulation of macroautophagy • epidermal growth factor catabolic process • positive regulation of renal sodium excretion • negative regulation of blood pressure Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	27131	69178
Ensembl	ENSG00000089006	ENSMUSG00000027423
UniProt	Q9Y5X3 Q5QPE4	Q9D8U8
RefSeq (мРНК)	NM_152227 NM_001282454 NM_014426	NM_001199188 NM_024225
RefSeq (білок)	NP_001269383 NP_055241 NP_689413	NP_001186117 NP_077187
Локус (UCSC)	Хр. 20: 17.94 – 17.97 Mb	Хр. 2: 144.09 – 144.11 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SNX5 (англ. Sorting nexin 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 404 амінокислот, а молекулярна маса — 46 816.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAAVPELLQQ		QEEDRSKLRS		VSVDLNVDPS		LQIDIPDALS		ERDKVKFTVH
TKTTLPTFQS		PEFSVTRQHE		DFVWLHDTLI		ETTDYAGLII		PPAPTKPDFD
GPREKMQKLG		EGEGSMTKEE		FAKMKQELEA		EYLAVFKKTV		SSHEVFLQRL
SSHPVLSKDR		NFHVFLEYDQ		DLSVRRKNTK		EMFGGFFKSV		VKSADEVLFT
GVKEVDDFFE		QEKNFLINYY		NRIKDSCVKA		DKMTRSHKNV		ADDYIHTAAC
LHSLALEEPT		VIKKYLLKVA		ELFEKLRKVE		GRVSSDEDLK		LTELLRYYML
NIEAAKDLLY		RRTKALIDYE		NSNKALDKAR		LKSKDVKLAE		AHQQECCQKF
EQLSESAKEE		LINFKRKRVA		AFRKNLIEMS		ELEIKHARNN		VSLLQSCIDL
FKNN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, ендоцитоз, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ліпідами. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, клітинних відростках, цитоплазматичних везикулах, ендосомах.

Література

• Teasdale R.D., Loci D., Houghton F., Karlsson L., Gleeson P.A. (2001). A large family of endosome-localized proteins related to sorting nexin 1. Biochem. J. 358: 7—16. PMID 11485546 DOI:10.1042/0264-6021:3580007
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Lim J.P., Wang J.T., Kerr M.C., Teasdale R.D., Gleeson P.A. (2008). A role for SNX5 in the regulation of macropinocytosis. BMC Cell Biol. 9: 58—58. PMID 18854019 DOI:10.1186/1471-2121-9-58
• Sun Y., Hedman A.C., Tan X., Schill N.J., Anderson R.A. (2013). Endosomal type Igamma PIP 5-kinase controls EGF receptor lysosomal sorting. Dev. Cell. 25: 144—155. PMID 23602387 DOI:10.1016/j.devcel.2013.03.010
• Schill N.J., Hedman A.C., Choi S., Anderson R.A. (2014). Isoform 5 of PIPKIgamma regulates the endosomal trafficking and degradation of E-cadherin. J. Cell Sci. 127: 2189—2203. PMID 24610942 DOI:10.1242/jcs.132423

Див. також

• Хромосома 20