SNX9

SNX9
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2RAI, 2RAJ, 2RAK, 3DYT, 3DYU, 3LGE
Ідентифікатори
Символи	SNX9, SDP1, SH3PX1, SH3PXD3A, WISP, sorting nexin 9
Зовнішні ІД	OMIM: 605952 MGI: 1913866 HomoloGene: 49454 GeneCards: SNX9
Онтологія гена Молекулярна функція • protein homodimerization activity • Arp2/3 complex binding • 1-phosphatidylinositol binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • phosphatidylinositol binding • ubiquitin protein ligase binding • lipid binding • cadherin binding • identical protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • комплекс Ґольджі • cell projection • мембрана • ruffle • extrinsic component of cytoplasmic side of plasma membrane • клітинна мембрана • trans-Golgi network • екзосома • cytoplasmic vesicle membrane • clathrin-coated vesicle • гіалоплазма • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • cuticular plate Біологічний процес • ендоцитоз • cleavage furrow formation • mitotic cytokinesis • positive regulation of membrane protein ectodomain proteolysis • рецептор-опосередкований ендоцитоз • plasma membrane tubulation • поділ клітини • endosomal transport • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • positive regulation of protein oligomerization • protein transport • lipid tube assembly • клітинний цикл • intracellular protein transport • positive regulation of protein kinase activity • membrane organization • GO:0007067 мітоз • GO:0015915 транспорт • positive regulation of actin filament polymerization Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	51429	66616
Ensembl	ENSG00000130340	ENSMUSG00000002365
UniProt	Q9Y5X1	Q91VH2
RefSeq (мРНК)	NM_016224	NM_025664
RefSeq (білок)	NP_057308	NP_079940
Локус (UCSC)	Хр. 6: 157.7 – 157.95 Mb	Хр. 17: 5.89 – 5.98 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SNX9 (англ. Sorting nexin 9) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 595 амінокислот, а молекулярна маса — 66 592.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MATKARVMYD		FAAEPGNNEL		TVNEGEIITI		TNPDVGGGWL		EGRNIKGERG
LVPTDYVEIL		PSDGKDQFSC		GNSVADQAFL		DSLSASTAQA		SSSAASNNHQ
VGSGNDPWSA		WSASKSGNWE		SSEGWGAQPE		GAGAQRNTNT		PNNWDTAFGH
PQAYQGPATG		DDDDWDEDWD		GPKSSSYFKD		SESADAGGAQ		RGNSRASSSS
MKIPLNKFPG		FAKPGTEQYL		LAKQLAKPKE		KIPIIVGDYG		PMWVYPTSTF
DCVVADPRKG		SKMYGLKSYI		EYQLTPTNTN		RSVNHRYKHF		DWLYERLLVK
FGSAIPIPSL		PDKQVTGRFE		EEFIKMRMER		LQAWMTRMCR		HPVISESEVF
QQFLNFRDEK		EWKTGKRKAE		RDELAGVMIF		STMEPEAPDL		DLVEIEQKCE
AVGKFTKAMD		DGVKELLTVG		QEHWKRCTGP		LPKEYQKIGK		ALQSLATVFS
SSGYQGETDL		NDAITEAGKT		YEEIASLVAE		QPKKDLHFLM		ECNHEYKGFL
GCFPDIIGTH		KGAIEKVKES		DKLVATSKIT		LQDKQNMVKR		VSIMSYALQA
EMNHFHSNRI		YDYNSVIRLY		LEQQVQFYET		IAEKLRQALS		RFPVM

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, клітинний цикл, поділ клітини, мітоз, ендоцитоз, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з ліпідами. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, клітинних відростках, цитоплазматичних везикулах, апараті гольджі.

Література

• Teasdale R.D., Loci D., Houghton F., Karlsson L., Gleeson P.A. (2001). A large family of endosome-localized proteins related to sorting nexin 1. Biochem. J. 358: 7—16. PMID 11485546 DOI:10.1042/0264-6021:3580007
• Howard L., Nelson K.K., Maciewicz R.A., Blobel C.P. (1999). Interaction of the metalloprotease disintegrins MDC9 and MDC15 with two SH3 domain-containing proteins, endophilin I and SH3PX1. J. Biol. Chem. 274: 31693—31699. PMID 10531379 DOI:10.1074/jbc.274.44.31693
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Lin Q., Lo C.G., Cerione R.A., Yang W. (2002). The Cdc42 target ACK2 interacts with sorting nexin 9 (SH3PX1) to regulate epidermal growth factor receptor degradation. J. Biol. Chem. 277: 10134—10138. PMID 11799118 DOI:10.1074/jbc.M110329200
• Lundmark R., Carlsson S.R. (2003). Sorting nexin 9 participates in clathrin-mediated endocytosis through interactions with the core components. J. Biol. Chem. 278: 46772—46781. PMID 12952949 DOI:10.1074/jbc.M307334200
• Yeow-Fong L., Lim L., Manser E. (2005). SNX9 as an adaptor for linking synaptojanin-1 to the Cdc42 effector ACK1. FEBS Lett. 579: 5040—5048. PMID 16137687 DOI:10.1016/j.febslet.2005.07.093

Див. також

• Хромосома 6