SORBS1

SORBS1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2DL3, 2ECZ, 2LJ0, 2MOX, 2O2W, 2O31, 2O9S, 2O9V, 4LN2, 4LNP
Ідентифікатори
Символи	SORBS1, CAP, FLAF2, R85FL, SH3D5, SH3P12, SORB1, sorbin and SH3 domain containing 1
Зовнішні ІД	OMIM: 605264 MGI: 700014 HomoloGene: 83252 GeneCards: SORBS1
Пов'язані генетичні захворювання
ожиріння
Онтологія гена Молекулярна функція • insulin receptor binding • cytoskeletal protein binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • actin binding Клітинна компонента • гіалоплазма • центросома • мембрана • focal adhesion • nuclear matrix • Адгезивні контакти • клітинна мембрана • stress fiber • міжклітинні контакти • zonula adherens • membrane raft • цитоскелет • клітинне ядро • insulin receptor complex • цитоплазма Біологічний процес • positive regulation of glucose import • positive regulation of glycogen biosynthetic process • м'язове скорочення • positive regulation of lipid biosynthetic process • actin filament organization • stress fiber assembly • focal adhesion assembly • cellular response to insulin stimulus • cell-matrix adhesion • positive regulation of signal transduction • positive regulation of protein localization to plasma membrane • GO:1901047 insulin receptor signaling pathway • GO:1903106 positive regulation of insulin receptor signaling pathway Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10580	20411
Ensembl	ENSG00000095637	ENSMUSG00000025006
UniProt	Q9BX66	Q62417
RefSeq (мРНК)	NM_001034954 NM_001034955 NM_001034956 NM_001034957 NM_001290294 NM_001290295 NM_001290296 NM_001290297 NM_001290298 NM_006434 NM_015385 NM_024991 NM_001377197 NM_001377198 NM_001377199 NM_001377200 NM_001377201 NM_001377202 NM_001377203 NM_001377204 NM_001377205 NM_001377206 NM_001377207 NM_001377208 NM_001377209 NM_001384447 NM_001384448 NM_001384449 NM_001384450 NM_001384451 NM_001384452 NM_001384453 NM_001384454 NM_001384455 NM_001384456 NM_001384457 NM_001384458 NM_001384459 NM_001384460 NM_001384461 NM_001384462 NM_001384463 NM_001384464 NM_001384465	NM_001034962 NM_001034963 NM_001034964 NM_009166 NM_178362
RefSeq (білок)	NP_001030126 NP_001030127 NP_001030128 NP_001030129 NP_001277223 NP_001277224 NP_001277225 NP_001277226 NP_001277227 NP_006425 NP_056200 NP_079267 NP_001364126 NP_001364127 NP_001364128 NP_001364129 NP_001364130 NP_001364131 NP_001364132 NP_001364133 NP_001364134 NP_001364135 NP_001364136 NP_001364137 NP_001364138	NP_001030134 NP_001030135 NP_001030136 NP_033192 NP_848139 NP_001389984 NP_001389985
Локус (UCSC)	Хр. 10: 95.31 – 95.56 Mb	Хр. 19: 40.29 – 40.51 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SORBS1 (англ. Sorbin and SH3 domain containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 292 амінокислот, а молекулярна маса — 142 513.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSSECDGGSK		AVMNGLAPGS		NGQDKATADP		LRARSISAVK		IIPVKTVKNA
SGLVLPTDMD		LTKICTGKGA		VTLRASSSYR		ETPSSSPASP		QETRQHESKP
GLEPEPSSAD		EWRLSSSADA		NGNAQPSSLA		AKGYRSVHPN		LPSDKSQDAT
SSSAAQPEVI		VVPLYLVNTD		RGQEGTARPP		TPLGPLGCVP		TIPATASAAS
PLTFPTLDDF		IPPHLQRWPH		HSQPARASGS		FAPISQTPPS		FSPPPPLVPP
APEDLRRVSE		PDLTGAVSST		DSSPLLNEVS		SSLIGTDSQA		FPSVSKPSSA
YPSTTIVNPT		IVLLQHNREQ		QKRLSSLSDP		VSERRVGEQD		SAPTQEKPTS
PGKAIEKRAK		DDSRRVVKST		QDLSDVSMDE		VGIPLRNTER		SKDWYKTMFK
QIHKLNRDTP		EENPYFPTYK		FPELPEIQQT		SEEDNPYTPT		YQFPASTPSP
KSEDDDSDLY		SPRYSFSEDT		KSPLSVPRSK		SEMSYIDGEK		VVKRSATLPL
PARSSSLKSS		SERNDWEPPD		KKVDTRKYRA		EPKSIYEYQP		GKSSVLTNEK
MSRDISPEEI		DLKNEPWYKF		FSELEFGKPP		PKKIWDYTPG		DCSILPREDR
KTNLDKDLSL		CQTELEADLE		KMETLNKAPS		ANVPQSSAIS		PTPEISSETP
GYIYSSNFHA		VKRESDGAPG		DLTSLENERQ		IYKSVLEGGD		IPLQGLSGLK
RPSSSASTKD		SESPRHFIPA		DYLESTEEFI		RRRHDDKEKL		LADQRRLKRE
QEEADIAARR		HTGVIPTHHQ		FITNERFGDL		LNIDDTAKRK		SGSEMRPARA
KFDFKAQTLK		ELPLQKGDIV		YIYKQIDQNW		YEGEHHGRVG		IFPRTYIELL
PPAEKAQPKK		LTPVQVLEYG		EAIAKFNFNG		DTQVEMSFRK		GERITLLRQV
DENWYEGRIP		GTSRQGIFPI		TYVDVIKRPL		VKNPVDYMDL		PFSSSPSRSA
TASPQFSSHS		KLITPAPSSL		PHSRRALSPE		MHAVTSEWIS		LTVGVPGRRS
LALTPPLPPL		PEASIYNTDH		LALSPRASPS		LSLSLPHLSW		SDRPTPRSVA
SPLALPSPHK		TYSLAPTSQA		SLHMNGDGGV		HTPSSGIHQD		SFLQLPLGSS
DSVISQLSDA		FSSQSKRQPW		REESGQYERK		AERGAGERGP		GGPKISKKSC
LKPSDVVRCL		STEQRLSDLN		TPEESRPGKP		LGSAFPGSEA		EQTERHRGGE
QAGRKAARRG		GSQQPQAQQR		RVTPDRSQTS		QDLFSYQALY		SYIPQNDDEL
ELRDGDIVDV		MEKCDDGWFV		GTSRRTKQFG		TFPGNYVKPL		YL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, мембрані, клітинних контактах.

Література

• Vandenbroere I., Paternotte N., Dumont J.E., Erneux C., Pirson I. (2003). The c-Cbl-associated protein and c-Cbl are two new partners of the SH2-containing inositol polyphosphate 5-phosphatase SHIP2. Biochem. Biophys. Res. Commun. 300: 494—500. PMID 12504111 DOI:10.1016/S0006-291X(02)02894-2
• Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVI. The complete sequences of 150 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 65—73. PMID 10718198 DOI:10.1093/dnares/7.1.65
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Margiolaki I., Wright J.P., Wilmanns M., Fitch A.N., Pinotsis N. (2007). Second SH3 domain of ponsin solved from powder diffraction. J. Am. Chem. Soc. 129: 11865—11871. PMID 17784760 DOI:10.1021/ja073846c

Див. також

• Хромосома 10