SPECC1

SPECC1
Ідентифікатори
Символи	SPECC1, CYTSB, HCMOGT-1, HCMOGT1, NSP, sperm antigen with calponin homology and coiled-coil domains 1, NSP5
Зовнішні ІД	OMIM: 608793 MGI: 2442356 HomoloGene: 45157 GeneCards: SPECC1
Пов'язані генетичні захворювання
ожиріння
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	92521	432572
Ensembl	ENSG00000128487	ENSMUSG00000042331
UniProt	Q5M775	Q5SXY1
RefSeq (мРНК)	NM_001033553 NM_001033554 NM_001033555 NM_001243438 NM_001243439 NM_152904 NM_001386077 NM_001386078 NM_001386079 NM_001386080 NM_001386081 NM_001386082 NM_001386083 NM_001386084 NM_001386085	NM_001029936 NM_001281818 NM_001310526
RefSeq (білок)	NP_001028725 NP_001028726 NP_001028727 NP_001230367 NP_001230368 NP_690868	NP_001025107 NP_001268747 NP_001297455
Локус (UCSC)	Хр. 17: 20.01 – 20.32 Mb	Хр. 11: 61.85 – 62.11 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SPECC1 (англ. Sperm antigen with calponin homology and coiled-coil domains 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 068 амінокислот, а молекулярна маса — 118 585.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRSAAKPWNP		AIRAGGHGPD		RVRPLPAASS		GMKSSKSSTS		LAFESRLSRL
KRASSEDTLN		KPGSTAASGV		VRLKKTATAG		AISELTESRL		RSGTGAFTTT
KRTGIPAPRE		FSVTVSRERS		VPRGPSNPRK		SVSSPTSSNT		PTPTKHLRTP
STKPKQENEG		GEKAALESQV		RELLAEAKAK		DSEINRLRSE		LKKYKEKRTL
NAEGTDALGP		NVDGTSVSPG		DTEPMIRALE		EKNKNFQKEL		SDLEEENRVL
KEKLIYLEHS		PNSEGAASHT		GDSSCPTSIT		QESSFGSPTG		NQMSSDIDEY
KKNIHGNALR		TSGSSSSDVT		KASLSPDASD		FEHITAETPS		RPLSSTSNPF
KSSKCSTAGS		SPNSVSELSL		ASLTEKIQKM		EENHHSTAEE		LQATLQELSD
QQQMVQELTA		ENEKLVDEKT		ILETSFHQHR		ERAEQLSQEN		EKLMNLLQER
VKNEEPTTQE		GKIIELEQKC		TGILEQGRFE		REKLLNIQQQ		LTCSLRKVEE
ENQGALEMIK		RLKEENEKLN		EFLELERHNN		NMMAKTLEEC		RVTLEGLKME
NGSLKSHLQG		EKQKATEASA		VEQTAESCEV		QEMLKVARAE		KDLLELSCNE
LRQELLKANG		EIKHVSSLLA		KVEKDYSYLK		EICDHQAEQL		SRTSLKLQEK
ASESDAEIKD		MKETIFELED		QVEQHRAVKL		HNNQLISELE		SSVIKLEEQK
SDLERQLKTL		TKQMKEETEE		WRRFQADLQT		AVVVANDIKC		EAQQELRTVK
RKLLEEEEKN		ARLQKELGDV		QGHGRVVTSR		AAPPPVDEEP		ESSEVDAAGR
WPGVCVSRTS		PTPPESATTV		KSLIKSFDLG		RPGGAGQNIS		VHKTPRSPLS
GIPVRTAPAA		AVSPMQRHST		YSSVRPASRG		VTQRLDLPDL		PLSDILKGRT
ETLKPDPHLR		KSPSLESLSR		PPSLGFGDTR		LLSASTRAWK		PQSKLSVERK
DPLAALAREY		GGSKRNALLK		WCQKKTQGYA		NIDITNFSSS		WSDGLAFCAL
LHTYLPAHIP		YQELNSQEKK		RNLLLAFEAA		ESVGIKPSLE		LSEMLYTDRP
DWQSVMQYVA		QIYKYFET

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі, мембрані.

Література

• Sang N., Fath D.M., Giordano A. (2004). A gene highly expressed in tumor cells encodes novel structure proteins. Oncogene. 23: 9438—9446. PMID 15602574 DOI:10.1038/sj.onc.1207988
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 17