SPSB1

SPSB1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2JK9, 3F2O
Ідентифікатори
Символи	SPSB1, SSB-1, SSB1, splA/ryanodine receptor domain and SOCS box containing 1
Зовнішні ІД	OMIM: 611657 MGI: 1921896 HomoloGene: 11832 GeneCards: SPSB1
Пов'язані генетичні захворювання
сибірка, ревматоїдний артрит
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • ubiquitin ligase-substrate adaptor activity Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • SCF ubiquitin ligase complex Біологічний процес • Убіквітин-залежний протеоліз • protein polyubiquitination • посттрансляційна модифікація • ubiquitin-dependent protein catabolic process • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	80176	74646
Ensembl	ENSG00000171621	ENSMUSG00000039911
UniProt	Q96BD6	Q9D5L7
RefSeq (мРНК)	NM_025106	NM_029035
RefSeq (білок)	NP_079382	NP_083311
Локус (UCSC)	Хр. 1: 9.29 – 9.37 Mb	Хр. 4: 149.98 – 150.04 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SPSB1 (англ. SplA/ryanodine receptor domain and SOCS box containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 273 амінокислот, а молекулярна маса — 30 942.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGQKVTGGIK		TVDMRDPTYR		PLKQELQGLD		YCKPTRLDLL		LDMPPVSYDV
QLLHSWNNND		RSLNVFVKED		DKLIFHRHPV		AQSTDAIRGK		VGYTRGLHVW
QITWAMRQRG		THAVVGVATA		DAPLHSVGYT		TLVGNNHESW		GWDLGRNRLY
HDGKNQPSKT		YPAFLEPDET		FIVPDSFLVA		LDMDDGTLSF		IVDGQYMGVA
FRGLKGKKLY		PVVSAVWGHC		EIRMRYLNGL		DPEPLPLMDL		CRRSVRLALG
RERLGEIHTL		PLPASLKAYL		LYQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі як убіквітинування білків. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Wang D., Li Z., Messing E.M., Wu G. (2005). The SPRY domain-containing SOCS box protein 1 (SSB-1) interacts with MET and enhances the hepatocyte growth factor-induced Erk-Elk-1-serum response element pathway. J. Biol. Chem. 280: 16393—16401. PMID 15713673 DOI:10.1074/jbc.M413897200
• Woo J.S., Suh H.Y., Park S.Y., Oh B.H. (2006). Structural basis for protein recognition by B30.2/SPRY domains. Mol. Cell. 24: 967—976. PMID 17189197 DOI:10.1016/j.molcel.2006.11.009

Див. також

• Хромосома 1