SRPRA

SRPRA
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2FH5, 2GO5, 5L3Q
Ідентифікатори
Символи	SRPRA, DP, Sralpha, SRPR, SRP receptor alpha subunit, SRP receptor subunit alpha
Зовнішні ІД	OMIM: 182180 MGI: 1914648 HomoloGene: 2364 GeneCards: SRPRA
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • signal recognition particle binding • GTP binding • GO:0006184 GTPase activity • RNA binding Клітинна компонента • signal recognition particle receptor complex • integral component of membrane • екзосома • endoplasmic reticulum membrane • ендоплазматичний ретикулум • мембрана Біологічний процес • IRE1-mediated unfolded protein response • intracellular protein transport • cotranslational protein targeting to membrane • SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane • GO:0015915 транспорт • сортування білків • protein targeting to ER Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6734	67398
Ensembl	ENSG00000182934	ENSMUSG00000032042
UniProt	P08240	Q9DBG7
RefSeq (мРНК)	NM_003139 NM_001177842	NM_026130
RefSeq (білок)	NP_001171313 NP_003130	NP_080406
Локус (UCSC)	Хр. 11: 126.26 – 126.27 Mb	Хр. 9: 35.11 – 35.16 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SRPRA (англ. SRP receptor alpha subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 638 амінокислот, а молекулярна маса — 69 811.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLDFFTIFSK		GGLVLWCFQG		VSDSCTGPVN		ALIRSVLLQE		RGGNNSFTHE
ALTLKYKLDN		QFELVFVVGF		QKILTLTYVD		KLIDDVHRLF		RDKYRTEIQQ
QSALSLLNGT		FDFQNDFLRL		LREAEESSKI		RAPTTMKKFE		DSEKAKKPVR
SMIETRGEKP		KEKAKNSKKK		GAKKEGSDGP		LATSKPVPAE		KSGLPVGPEN
GVELSKEELI		RRKREEFIQK		HGRGMEKSNK		STKSDAPKEK		GKKAPRVWEL
GGCANKEVLD		YSTPTTNGTP		EAALSEDINL		IRGTGSGGQL		QDLDCSSSDD
EGAAQNSTKP		SATKGTLGGM		FGMLKGLVGS		KSLSREDMES		VLDKMRDHLI
AKNVAADIAV		QLCESVANKL		EGKVMGTFST		VTSTVKQALQ		ESLVQILQPQ
RRVDMLRDIM		DAQRRQRPYV		VTFCGVNGVG		KSTNLAKISF		WLLENGFSVL
IAACDTFRAG		AVEQLRTHTR		RLSALHPPEK		HGGRTMVQLF		EKGYGKDAAG
IAMEAIAFAR		NQGFDVVLVD		TAGRMQDNAP		LMTALAKLIT		VNTPDLVLFV
GEALVGNEAV		DQLVKFNRAL		ADHSMAQTPR		LIDGIVLTKF		DTIDDKVGAA
ISMTYITSKP		IVFVGTGQTY		CDLRSLNAKA		VVAALMKA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, ГТФ. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі.

Література

• Hortsch M., Labeit S., Meyer D.I. (1988). Complete cDNA sequence coding for human docking protein. Nucleic Acids Res. 16: 361—362. PMID 3340536 DOI:10.1093/nar/16.1.361
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Schlenker O., Hendricks A., Sinning I., Wild K. (2006). The structure of the mammalian signal recognition particle (SRP) receptor as prototype for the interaction of small GTPases with Longin domains. J. Biol. Chem. 281: 8898—8906. PMID 16439358 DOI:10.1074/jbc.M512415200

Див. також

• Хромосома 11