SRSF10

SRSF10
Ідентифікатори
Символи	SRSF10, FUSIP1, FUSIP2, NSSR, PPP1R149, SFRS13, SFRS13A, SRp38, SRrp40, TASR, TASR1, TASR2, serine/arginine-rich splicing factor 10, serine and arginine rich splicing factor 10
Зовнішні ІД	OMIM: 605221 MGI: 1333805 HomoloGene: 134051 GeneCards: SRSF10
Онтологія гена Молекулярна функція • unfolded protein binding • RS domain binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • RNA binding Клітинна компонента • цитоплазма • клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма • nuclear speck Біологічний процес • RNA splicing, via transesterification reactions • mRNA splicing, via spliceosome • mRNA processing • spliceosomal tri-snRNP complex assembly • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of mRNA splicing, via spliceosome • mRNA splice site selection • mRNA export from nucleus • Сплайсинг РНК • regulation of mRNA splicing, via spliceosome • cytosolic transport • regulation of RNA splicing • regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome • mRNA 5'-splice site recognition • mRNA cis splicing, via spliceosome Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10772	14105
Ensembl	ENSG00000188529	ENSMUSG00000028676
UniProt	O75494 Q5JRI1	Q9R0U0
RefSeq (мРНК)	NM_001191005 NM_001191006 NM_001191007 NM_001191009 NM_001300936 NM_001300937 NM_006625 NM_054016	NM_001080387 NM_001284195 NM_001284196 NM_010178
RefSeq (білок)	NP_001177934 NP_001177935 NP_001177936 NP_001177938 NP_001287865 NP_001287866 NP_006616 NP_473357 NP_001287865.1	NP_001073856 NP_001271124 NP_001271125 NP_034308
Локус (UCSC)	Хр. 1: 23.96 – 23.98 Mb	Хр. 4: 135.58 – 135.6 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SRSF10 (англ. Serine and arginine rich splicing factor 10) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 262 амінокислот, а молекулярна маса — 31 301.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSRYLRPPNT		SLFVRNVADD		TRSEDLRREF		GRYGPIVDVY		VPLDFYTRRP
RGFAYVQFED		VRDAEDALHN		LDRKWICGRQ		IEIQFAQGDR		KTPNQMKAKE
GRNVYSSSRY		DDYDRYRRSR		SRSYERRRSR		SRSFDYNYRR		SYSPRNSRPT
GRPRRSRSHS		DNDRFKHRNR		SFSRSKSNSR		SRSKSQPKKE		MKAKSRSRSA
SHTKTRGTSK		TDSKTHYKSG		SRYEKESRKK		EPPRSKSQSR		SQSRSRSKSR
SRSWTSPKSS		GH

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Yang L., Embree L.J., Tsai S., Hickstein D.D. (1998). Oncoprotein TLS interacts with serine-arginine proteins involved in RNA splicing. J. Biol. Chem. 273: 27761—27764. PMID 9774382 DOI:10.1074/jbc.273.43.27761
• Yang L., Embree L.J., Hickstein D.D. (2000). TLS-ERG leukemia fusion protein inhibits RNA splicing mediated by serine-arginine proteins. Mol. Cell. Biol. 20: 3345—3354. PMID 10779324 DOI:10.1128/MCB.20.10.3345-3354.2000
• Cowper A.E., Caceres J.F., Mayeda A., Screaton G.R. (2001). Serine-arginine (SR) protein-like factors that antagonize authentic SR proteins and regulate alternative splicing. J. Biol. Chem. 276: 48908—48914. PMID 11684676 DOI:10.1074/jbc.M103967200
• Shin C., Manley J.L. (2002). The SR protein SRp38 represses splicing in M Phase cells. Cell. 111: 407—417. PMID 12419250 DOI:10.1016/S0092-8674(02)01038-3
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Shin C., Feng Y., Manley J.L. (2004). Dephosphorylated SRp38 acts as a splicing repressor in response to heat shock. Nature. 427: 553—558. PMID 14765198 DOI:10.1038/nature02288

Див. також

• Хромосома 1