SRSF12

SRSF12
Ідентифікатори
Символи	SRSF12, SFRS13B, SFRS19, SRrp35, serine/arginine-rich splicing factor 12, serine and arginine rich splicing factor 12
Зовнішні ІД	HomoloGene: 25874 GeneCards: SRSF12
Онтологія гена Молекулярна функція • unfolded protein binding • RS domain binding • nucleic acid binding • RNA binding Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма • nuclear speck Біологічний процес • mRNA 5'-splice site recognition • mRNA processing • spliceosomal tri-snRNP complex assembly • negative regulation of mRNA splicing, via spliceosome • Сплайсинг РНК • regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome • mRNA cis splicing, via spliceosome Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	135295	297962
Ensembl	ENSG00000154548	ENSRNOG00000051383
UniProt	Q8WXF0	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_080743 NM_001376896 NM_001376897 NM_001376898	NM_001135711
RefSeq (білок)	NP_542781 NP_001363825 NP_001363826 NP_001363827	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 6: 89.1 – 89.12 Mb	н/д
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SRSF12 (англ. Serine and arginine rich splicing factor 12) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 6-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 261 амінокислот, а молекулярна маса — 30 512.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSRYTRPPNT		SLFIRNVADA		TRPEDLRREF		GRYGPIVDVY		IPLDFYTRRP
RGFAYVQFED		VRDAEDALYN		LNRKWVCGRQ		IEIQFAQGDR		KTPGQMKSKE
RHPCSPSDHR		RSRSPSQRRT		RSRSSSWGRN		RRRSDSLKES		RHRRFSYSQS
KSRSKSLPRR		STSARQSRTP		RRNFGSRGRS		RSKSLQKRSK		SIGKSQSSSP
QKQTSSGTKS		RSHGRHSDSI		ARSPCKSPKG		YTNSETKVQT		AKHSHFRSHS
RSRSYRHKNS		W

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Cowper A.E., Caceres J.F., Mayeda A., Screaton G.R. (2001). Serine-arginine (SR) protein-like factors that antagonize authentic SR proteins and regulate alternative splicing. J. Biol. Chem. 276: 48908—48914. PMID 11684676 DOI:10.1074/jbc.M103967200
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 6