SRSF2

SRSF2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2KN4, 2LEA, 2LEB, 2LEC
Ідентифікатори
Символи	SRSF2, PR264, SC-35, SC35, SFRS2, SFRS2A, SRp30b, serine/arginine-rich splicing factor 2, serine and arginine rich splicing factor 2
Зовнішні ІД	OMIM: 600813 MGI: 98284 HomoloGene: 37721 GeneCards: SRSF2
Пов'язані генетичні захворювання
гострий мієлоїдний лейкоз
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001106 transcription corepressor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • RNA binding • protein kinase C binding • pre-mRNA binding Клітинна компонента • PML body • nuclear speck • нуклеоплазма • екзосома • клітинне ядро • гіалоплазма • spliceosomal complex • interchromatin granule • цитоплазма Біологічний процес • mRNA splicing, via spliceosome • termination of RNA polymerase II transcription • mRNA processing • mRNA export from nucleus • Сплайсинг РНК • mRNA 3'-end processing • RNA export from nucleus • negative regulation of nucleic acid-templated transcription • GO:0007067 мітоз • regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome • response to vitamin E • regulation of RNA splicing • mRNA cis splicing, via spliceosome Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6427	20382
Ensembl	ENSG00000161547	ENSMUSG00000034120
UniProt	Q01130	Q62093
RefSeq (мРНК)	NM_001195427 NM_003016	NM_011358
RefSeq (білок)	NP_001182356 NP_003007	NP_035488
Локус (UCSC)	Хр. 17: 76.73 – 76.74 Mb	Хр. 11: 116.85 – 116.85 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SRSF2 (англ. Serine and arginine rich splicing factor 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 221 амінокислот, а молекулярна маса — 25 476.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSYGRPPPDV		EGMTSLKVDN		LTYRTSPDTL		RRVFEKYGRV		GDVYIPRDRY
TKESRGFAFV		RFHDKRDAED		AMDAMDGAVL		DGRELRVQMA		RYGRPPDSHH
SRRGPPPRRY		GGGGYGRRSR		SPRRRRRSRS		RSRSRSRSRS		RSRYSRSKSR
SRTRSRSRST		SKSRSARRSK		SKSSSVSRSR		SRSRSRSRSR		SPPPVSKRES
KSRSRSKSPP		KSPEEEGAVS		S

A: Аланін
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Fu X.-D., Maniatis T. (1992). Isolation of a complementary DNA that encodes the mammalian splicing factor SC35. Science. 256: 535—538. PMID 1373910 DOI:10.1126/science.1373910
• Vellard M., Sureau A., Soret J., Martinerie C., Perbal B. (1992). A potential splicing factor is encoded by the opposite strand of the trans-spliced c-myb exon. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 89: 2511—2515. PMID 1557353 DOI:10.1073/pnas.89.7.2511
• Sureau A., Perbal B. (1994). Several mRNAs with variable 3' untranslated regions and different stability encode the human PR264/SC35 splicing factor. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 91: 932—936. PMID 8302870 DOI:10.1073/pnas.91.3.932
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Sureau A., Soret J., Vellard M., Crochet J., Perbal B. (1992). The PR264/c-myb connection: expression of a splicing factor modulated by a nuclear protooncogene. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 89: 11683—11687. PMID 1465383 DOI:10.1073/pnas.89.24.11683
• Zahler A.M., Lane W.S., Stolk J.A., Roth M.B. (1992). SR proteins: a conserved family of pre-mRNA splicing factors. Genes Dev. 6: 837—847. PMID 1577277 DOI:10.1101/gad.6.5.837

Див. також

• Хромосома 17