SRSF4

SRSF4
Ідентифікатори
Символи	SRSF4, SFRS4, SRP75, serine/arginine-rich splicing factor 4, serine and arginine rich splicing factor 4
Зовнішні ІД	OMIM: 601940 MGI: 1890577 HomoloGene: 25624 GeneCards: SRSF4
Онтологія гена Молекулярна функція • sequence-specific mRNA binding • nucleic acid binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • nucleotide binding Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма • nuclear speck Біологічний процес • RNA splicing, via transesterification reactions • mRNA splicing, via spliceosome • termination of RNA polymerase II transcription • mRNA processing • negative regulation of mRNA splicing, via spliceosome • mRNA 3'-end processing • mRNA export from nucleus • Сплайсинг РНК • RNA export from nucleus • response to insulin • regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome • mRNA cis splicing, via spliceosome Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6429	57317
Ensembl	ENSG00000116350	ENSMUSG00000028911
UniProt	Q08170	Q8VE97
RefSeq (мРНК)	NM_005626	NM_020587
RefSeq (білок)	NP_005617	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 1: 29.15 – 29.18 Mb	Хр. 4: 131.87 – 131.9 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SRSF4 (англ. Serine and arginine rich splicing factor 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 494 амінокислот, а молекулярна маса — 56 678.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPRVYIGRLS		YQARERDVER		FFKGYGKILE		VDLKNGYGFV		EFDDLRDADD
AVYELNGKDL		CGERVIVEHA		RGPRRDGSYG		SGRSGYGYRR		SGRDKYGPPT
RTEYRLIVEN		LSSRCSWQDL		KDYMRQAGEV		TYADAHKGRK		NEGVIEFVSY
SDMKRALEKL		DGTEVNGRKI		RLVEDKPGSR		RRRSYSRSRS		HSRSRSRSRH
SRKSRSRSGS		SKSSHSKSRS		RSRSGSRSRS		KSRSRSQSRS		RSKKEKSRSP
SKEKSRSRSH		SAGKSRSKSK		DQAEEKIQNN		DNVGKPKSRS		PSRHKSKSKS
RSRSQERRVE		EEKRGSVSRG		RSQEKSLRQS		RSRSRSKGGS		RSRSRSRSKS
KDKRKGRKRS		REESRSRSRS		RSKSERSRKR		GSKRDSKAGS		SKKKKKEDTD
RSQSRSPSRS		VSKEREHAKS		ESSQREGRGE		SENAGTNQET		RSRSRSNSKS
KPNLPSESRS		RSKSASKTRS		RSKSRSRSAS		RSPSRSRSRS		HSRS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Zahler A.M., Neugebauer K.M., Stolk J.A., Roth M.B. (1993). Human SR proteins and isolation of a cDNA encoding SRp75. Mol. Cell. Biol. 13: 4023—4028. PMID 8321209 DOI:10.1128/MCB.13.7.4023
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Zahler A.M., Lane W.S., Stolk J.A., Roth M.B. (1992). SR proteins: a conserved family of pre-mRNA splicing factors. Genes Dev. 6: 837—847. PMID 1577277 DOI:10.1101/gad.6.5.837
• Blencowe B.J., Issner R., Nickerson J.A., Sharp P.A. (1998). A coactivator of pre-mRNA splicing. Genes Dev. 12: 996—1009. PMID 9531537 DOI:10.1101/gad.12.7.996

Див. також

• Хромосома 1