SRSF7

SRSF7
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2HVZ
Ідентифікатори
Символи	SRSF7, 9G8, AAG3, SFRS7, serine/arginine-rich splicing factor 7, serine and arginine rich splicing factor 7
Зовнішні ІД	OMIM: 600572 MGI: 1926232 HomoloGene: 134446 GeneCards: SRSF7
Онтологія гена Молекулярна функція • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • RNA binding • protein domain specific binding Клітинна компонента • цитоплазма • нуклеоплазма • екзосома • клітинне ядро • nuclear speck Біологічний процес • mRNA splicing, via spliceosome • termination of RNA polymerase II transcription • mRNA transport • mRNA processing • mRNA export from nucleus • negative regulation of mRNA splicing, via spliceosome • mRNA 3'-end processing • RNA export from nucleus • Сплайсинг РНК • cellular response to leukemia inhibitory factor • GO:0015915 транспорт • regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome • mRNA cis splicing, via spliceosome Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6432	225027
Ensembl	ENSG00000115875	ENSMUSG00000024097
UniProt	Q16629	Q8BL97
RefSeq (мРНК)	NM_001031684 NM_001195446 NM_006276 NM_001363802	NM_001195485 NM_001195486 NM_001195487 NM_146083 NM_001360435
RefSeq (білок)	NP_001026854 NP_001182375 NP_001350731	NP_001182414 NP_001182415 NP_001182416 NP_666195 NP_001347364
Локус (UCSC)	Хр. 2: 38.74 – 38.75 Mb	Хр. 17: 80.51 – 80.51 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SRSF7 (англ. Serine and arginine rich splicing factor 7) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 238 амінокислот, а молекулярна маса — 27 367.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSRYGRYGGE		TKVYVGNLGT		GAGKGELERA		FSYYGPLRTV		WIARNPPGFA
FVEFEDPRDA		EDAVRGLDGK		VICGSRVRVE		LSTGMPRRSR		FDRPPARRPF
DPNDRCYECG		EKGHYAYDCH		RYSRRRRSRS		RSRSHSRSRG		RRYSRSRSRS
RGRRSRSASP		RRSRSISLRR		SRSASLRRSR		SGSIKGSRYF		QSPSRSRSRS
RSISRPRSSR		SKSRSPSPKR		SRSPSGSPRR		SASPERMD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК, транспорт, транспорт мРНК, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Popielarz M., Cavaloc Y., Mattei M.-G., Gattoni R., Stevenin J. (1995). The gene encoding human splicing factor 9G8. Structure, chromosomal localization, and expression of alternatively processed transcripts. J. Biol. Chem. 270: 17830—17835. PMID 7629084 DOI:10.1074/jbc.270.30.17830
• Kimura T., Hashimoto I., Nishizawa M., Ito S., Yamada H. (2010). Novel cis-active structures in the coding region mediate CRM1-dependent nuclear export of IFN-alpha 1 mRNA. Med. Mol. Morphol. 43: 145—157. PMID 20857263 DOI:10.1007/s00795-010-0492-5
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Huang Y., Steitz J.A. (2001). Splicing factors SRp20 and 9G8 promote the nucleocytoplasmic export of mRNA. Mol. Cell. 7: 899—905. PMID 11336712 DOI:10.1016/S1097-2765(01)00233-7
• Hu D., Mayeda A., Trembley J.H., Lahti J.M., Kidd V.J. (2003). CDK11 complexes promote pre-mRNA splicing. J. Biol. Chem. 278: 8623—8629. PMID 12501247 DOI:10.1074/jbc.M210057200
• Huang Y., Gattoni R., Stevenin J., Steitz J.A. (2003). SR splicing factors serve as adapter proteins for TAP-dependent mRNA export. Mol. Cell. 11: 837—843. PMID 12667464 DOI:10.1016/S1097-2765(03)00089-3

Див. також

• Хромосома 2