SSBP2

SSBP2
Ідентифікатори
Символи	SSBP2, HSPC116, SOSS-B2, single stranded DNA binding protein 2
Зовнішні ІД	OMIM: 607389 MGI: 1914220 HomoloGene: 22724 GeneCards: SSBP2
Пов'язані генетичні захворювання
гліобластома
Онтологія гена Молекулярна функція • single-stranded DNA binding • DNA binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • клітинне ядро Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23635	66970
Ensembl	ENSG00000145687	ENSMUSG00000003992
UniProt	P81877	Q9CYZ8
RefSeq (мРНК)	NM_001256732 NM_001256733 NM_001256734 NM_001256735 NM_001256736 NM_012446 NM_001345886 NM_001394350 NM_001394351 NM_001394352	NM_024186 NM_024272 NM_001360775 NM_001360776
RefSeq (білок)	NP_001243661 NP_001243662 NP_001243663 NP_001243664 NP_001243665 NP_001332815 NP_036578	NP_077148 NP_077234 NP_001347704 NP_001347705
Локус (UCSC)	Хр. 5: 81.41 – 81.75 Mb	Хр. 13: 91.46 – 91.7 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SSBP2 (англ. Single stranded DNA binding protein 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 361 амінокислот, а молекулярна маса — 37 828.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MYGKGKSNSS		AVPSDSQARE		KLALYVYEYL		LHVGAQKSAQ		TFLSEIRWEK
NITLGEPPGF		LHSWWCVFWD		LYCAAPERRE		TCEHSSEAKA		FHDYSAAAAP
SPVLGNIPPG		DGMPVGPVPP		GFFQPFMSPR		YPGGPRPPLR		IPNQALGGVP
GSQPLLPSGM		DPTRQQGHPN		MGGPMQRMTP		PRGMVPLGPQ		NYGGAMRPPL
NALGGPGMPG		MNMGPGGGRP		WPNPTNANSI		PYSSASPGNY		VGPPGGGGPP
GTPIMPSPAD		STNSGDNMYT		LMNAVPPGPN		RPNFPMGPGS		DGPMGGLGGM
ESHHMNGSLG		SGDMDSISKN		SPNNMSLSNQ		PGTPRDDGEM		GGNFLNPFQS
ESYSPSMTMS		V

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Castro P.D., Liang H., Liang J.C., Nagarajan L. (2002). A novel, evolutionarily conserved gene family with putative sequence-specific single-stranded DNA-binding activity. Genomics. 80: 78—85. PMID 12079286 DOI:10.1006/geno.2002.6805
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 5