SSU72

SSU72
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3O2Q, 3O2S, 4H3H, 4H3K
Ідентифікатори
Символи	SSU72, HSPC182, PNAS-120, SSU72 homolog, RNA polymerase II CTD phosphatase
Зовнішні ІД	OMIM: 617680 MGI: 1916241 HomoloGene: 6754 GeneCards: SSU72
Онтологія гена Молекулярна функція • RNA polymerase II CTD heptapeptide repeat phosphatase activity • phosphoprotein phosphatase activity • hydrolase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма • mRNA cleavage and polyadenylation specificity factor complex Біологічний процес • mRNA polyadenylation • mRNA processing • dephosphorylation of RNA polymerase II C-terminal domain • termination of RNA polymerase II transcription Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	29101	68991
Ensembl	ENSG00000160075	ENSMUSG00000029038
UniProt	Q9NP77	Q9CY97
RefSeq (мРНК)	NM_014188	NM_026899
RefSeq (білок)	NP_054907	NP_081175
Локус (UCSC)	Хр. 1: 1.54 – 1.57 Mb	Хр. 4: 155.79 – 155.82 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SSU72 (англ. SSU72 homolog, RNA polymerase II CTD phosphatase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 1-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 194 амінокислот, а молекулярна маса — 22 574.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPSSPLRVAV		VCSSNQNRSM		EAHNILSKRG		FSVRSFGTGT		HVKLPGPAPD
KPNVYDFKTT		YDQMYNDLLR		KDKELYTQNG		ILHMLDRNKR		IKPRPERFQN
CKDLFDLILT		CEERVYDQVV		EDLNSREQET		CQPVHVVNVD		IQDNHEEATL
GAFLICELCQ		CIQHTEDMEN		EIDELLQEFE		EKSGRTFLHT		VCFY

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеїн-фосфатаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Xiang K., Manley J.L., Tong L. (2012). An unexpected binding mode for a Pol II CTD peptide phosphorylated at Ser7 in the active site of the CTD phosphatase Ssu72. Genes Dev. 26: 2265—2270. PMID 23070812 DOI:10.1101/gad.198853.112

Див. також

• Хромосома 1