SSX2IP

SSX2IP
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1T2M, 1XZ9, 2AIN, 2EXG
Ідентифікатори
Символи	SSX2IP, ADIP, synovial sarcoma, X breakpoint 2 interacting protein, SSX family member 2 interacting protein, hMsd1
Зовнішні ІД	OMIM: 608690 MGI: 2139150 HomoloGene: 8522 GeneCards: SSX2IP
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein domain specific binding Клітинна компонента • цитоплазма • центр організації мікротрубочок • Адгезивні контакти • міжклітинні контакти • cell projection • цитоскелет • cell leading edge • клітинне ядро • ciliary basal body • centriolar satellite • GO:0009327 protein-containing complex Біологічний процес • regulation of cell motility • intraciliary transport involved in cilium assembly • regulation of Rac protein signal transduction • адгезія клітин • cell projection organization • cilium assembly • centrosome cycle Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	117178	99167
Ensembl	ENSG00000117155	ENSMUSG00000036825
UniProt	Q9Y2D8	Q8VC66
RefSeq (мРНК)	NM_001166293 NM_001166294 NM_001166295 NM_001166417 NM_014021	NM_001253768 NM_001253769 NM_001253770 NM_138744 NM_001355661
RefSeq (білок)	NP_001159765 NP_001159766 NP_001159767 NP_001159889 NP_054740	NP_001240697 NP_001240698 NP_001240699 NP_620083 NP_001342590
Локус (UCSC)	Хр. 1: 84.64 – 84.69 Mb	Хр. 3: 146.11 – 146.15 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SSX2IP (англ. SSX family member 2 interacting protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 614 амінокислот, а молекулярна маса — 71 236.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGDWMTVTDP		GLSSESKTIS		QYTSETKMSP		SSLYSQQVLC		SSIPLSKNVH
SFFSAFCTED		NIEQSISYLD		QELTTFGFPS		LYEESKGKET		KRELNIVAVL
NCMNELLVLQ		RKNLLAQENV		ETQNLKLGSD		MDHLQSCYSK		LKEQLETSRR
EMIGLQERDR		QLQCKNRNLH		QLLKNEKDEV		QKLQNIIASR		ATQYNHDMKR
KEREYNKLKE		RLHQLVMNKK		DKKIAMDILN		YVGRADGKRG		SWRTGKTEAR
NEDEMYKILL		NDYEYRQKQI		LMENAELKKV		LQQMKKEMIS		LLSPQKKKPR
ERVDDSTGTV		ISDVEEDAGE		LSRESMWDLS		CETVREQLTN		SIRKQWRILK
SHVEKLDNQV		SKVHLEGFND		EDVISRQDHE		QETEKLELEI		QQCKEMIKTQ
QQLLQQQLAT		AYDDDTTSLL		RDCYLLEEKE		RLKEEWSLFK		EQKKNFERER
RSFTEAAIRL		GLERKAFEEE		RASWLKQQFL		NMTTFDHQNS		ENVKLFSAFS
GSSDWDNLIV		HSRQPQKKPH		SVSNGSPVCM		SKLTKSLPAS		PSTSDFCQTR
SCISEHSSIN		VLNITAEEIK		PNQVGGECTN		QKWSVASRPG		SQEGCYSGCS
LSYTNSHVEK		DDLP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, біогенез та деградація війок, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, клітинних контактах, клітинних відростках.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Guinn B., Greiner J., Schmitt M., Mills K.I. (2009). Elevated expression of the leukemia-associated antigen SSX2IP predicts survival in acute myeloid leukemia patients who lack detectable cytogenetic rearrangements. Blood. 113: 1203—1204. PMID 19179477 DOI:10.1182/blood-2008-09-178848

Див. також

• Хромосома 1