STAG1

STAG1
Ідентифікатори
Символи	STAG1, SA1, SCC3A, stromal antigen 1, MRD47
Зовнішні ІД	OMIM: 604358 MGI: 1098658 HomoloGene: 21191 GeneCards: STAG1
Пов'язані генетичні захворювання
autosomal dominant mental retardation 47
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • chromatin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • хромосома • гіалоплазма • Хроматин • центромера • клітинне ядро • нуклеоплазма • ядерні тільця • GO:0000798 cohesin complex • nuclear matrix • mitotic spindle pole Біологічний процес • chromosome segregation • поділ клітини • клітинний цикл • transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • regulation of mitotic spindle assembly • sister chromatid cohesion Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10274	20842
Ensembl	ENSG00000118007	ENSMUSG00000037286
UniProt	Q8WVM7	Q9D3E6
RefSeq (мРНК)	NM_005862	NM_009282 NM_001357264 NM_001357265
RefSeq (білок)	NP_005853	NP_033308 NP_001344193 NP_001344194
Локус (UCSC)	Хр. 3: 136.34 – 136.75 Mb	Хр. 9: 100.48 – 100.84 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

STAG1 (англ. Stromal antigen 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 258 амінокислот, а молекулярна маса — 144 427.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MITSELPVLQ		DSTNETTAHS		DAGSELEETE		VKGKRKRGRP		GRPPSTNKKP
RKSPGEKSRI		EAGIRGAGRG		RANGHPQQNG		EGEPVTLFEV		VKLGKSAMQS
VVDDWIESYK		QDRDIALLDL		INFFIQCSGC		RGTVRIEMFR		NMQNAEIIRK
MTEEFDEDSG		DYPLTMPGPQ		WKKFRSNFCE		FIGVLIRQCQ		YSIIYDEYMM
DTVISLLTGL		SDSQVRAFRH		TSTLAAMKLM		TALVNVALNL		SIHQDNTQRQ
YEAERNKMIG		KRANERLELL		LQKRKELQEN		QDEIENMMNS		IFKGIFVHRY
RDAIAEIRAI		CIEEIGVWMK		MYSDAFLNDS		YLKYVGWTLH		DRQGEVRLKC
LKALQSLYTN		RELFPKLELF		TNRFKDRIVS		MTLDKEYDVA		VEAIRLVTLI
LHGSEEALSN		EDCENVYHLV		YSAHRPVAVA		AGEFLHKKLF		SRHDPQAEEA
LAKRRGRNSP		NGNLIRMLVL		FFLESELHEH		AAYLVDSLWE		SSQELLKDWE
CMTELLLEEP		VQGEEAMSDR		QESALIELMV		CTIRQAAEAH		PPVGRGTGKR
VLTAKERKTQ		IDDRNKLTEH		FIITLPMLLS		KYSADAEKVA		NLLQIPQYFD
LEIYSTGRME		KHLDALLKQI		KFVVEKHVES		DVLEACSKTY		SILCSEEYTI
QNRVDIARSQ		LIDEFVDRFN		HSVEDLLQEG		EEADDDDIYN		VLSTLKRLTS
FHNAHDLTKW		DLFGNCYRLL		KTGIEHGAMP		EQIVVQALQC		SHYSILWQLV
KITDGSPSKE		DLLVLRKTVK		SFLAVCQQCL		SNVNTPVKEQ		AFMLLCDLLM
IFSHQLMTGG		REGLQPLVFN		PDTGLQSELL		SFVMDHVFID		QDEENQSMEG
DEEDEANKIE		ALHKRRNLLA		AFSKLIIYDI		VDMHAAADIF		KHYMKYYNDY
GDIIKETLSK		TRQIDKIQCA		KTLILSLQQL		FNELVQEQGP		NLDRTSAHVS
GIKELARRFA		LTFGLDQIKT		REAVATLHKD		GIEFAFKYQN		QKGQEYPPPN
LAFLEVLSEF		SSKLLRQDKK		TVHSYLEKFL		TEQMMERRED		VWLPLISYRN
SLVTGGEDDR		MSVNSGSSSS		KTSSVRNKKG		RPPLHKKRVE		DESLDNTWLN
RTDTMIQTPG		PLPAPQLTST		VLRENSRPMG		DQIQEPESEH		GSEPDFLHNP
QMQISWLGQP		KLEDLNRKDR		TGMNYMKVRT		GVRHAVRGLM		EEDAEPIFED
VMMSSRSQLE		DMNEEFEDTM		VIDLPPSRNR		RERAELRPDF		FDSAAIIEDD
SGFGMPMF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинний цикл, поділ клітини, мітоз, розходження хромосом, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі, хромосомах, центромерах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Sumara I., Vorlaufer E., Gieffers C., Peters B.H., Peters J.-M. (2000). Characterization of vertebrate cohesin complexes and their regulation in prophase. J. Cell Biol. 151: 749—762. PMID 11076961 DOI:10.1083/jcb.151.4.749

Див. також

• Хромосома 3