STARD13

STARD13
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2H80, 2JW2, 2PSO
Ідентифікатори
Символи	STARD13, ARHGAP37, DLC2, GT650, LINC00464, StAR related lipid transfer domain containing 13
Зовнішні ІД	OMIM: 609866 MGI: 2385331 HomoloGene: 64844 GeneCards: STARD13
Пов'язані генетичні захворювання
аневризми судин головного мозку
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • lipid binding • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • lipid droplet • мітохондріальна мембрана • мітохондрія • мембрана Біологічний процес • negative regulation of cell migration involved in sprouting angiogenesis • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • endothelial tube lumen extension • regulation of small GTPase mediated signal transduction • endothelial cell migration • GO:0072468 сигнальна трансдукція Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	90627	243362
Ensembl	ENSG00000133121	ENSMUSG00000016128
UniProt	Q9Y3M8	Q923Q2
RefSeq (мРНК)	NM_001243466 NM_001243474 NM_001243476 NM_052851 NM_178006 NM_178007 NM_178008	NM_001163493 NM_146258 NM_001359985
RefSeq (білок)	NP_001230395 NP_001230403 NP_001230405 NP_443083 NP_821074 NP_821075	NP_001156965 NP_666370 NP_001346914
Локус (UCSC)	Хр. 13: 33.1 – 33.35 Mb	Хр. 5: 150.96 – 151.16 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

STARD13 (англ. StAR related lipid transfer domain containing 13) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 113 амінокислот, а молекулярна маса — 124 967.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MFSQVPRTPA		SGCYYLNSMT		PEGQEMYLRF		DQTTRRSPYR		MSRILARHQL
VTKIQQEIEA		KEACDWLRAA		GFPQYAQLYE		DSQFPINIVA		VKNDHDFLEK
DLVEPLCRRL		NTLNKCASMK		LDVNFQRKKG		DDSDEEDLCI		SNKWTFQRTS
RRWSRVDDLY		TLLPRGDRNG		SPGGTGMRNT		TSSESVLTDL		SEPEVCSIHS
ESSGGSDSRS		QPGQCCTDNP		VMLDAPLVSS		SLPQPPRDVL		NHPFHPKNEK
PTRARAKSFL		KRMETLRGKG		AHGRHKGSGR		TGGLVISGPM		LQQEPESFKA
MQCIQIPNGD		LQNSPPPACR		KGLPCSGKSS		GESSPSEHSS		SGVSTPCLKE
RKCHEANKRG		GMYLEDLDVL		AGTALPDAGD		QSRMHEFHSQ		ENLVVHIPKD
HKPGTFPKAL		SIESLSPTDS		SNGVNWRTGS		ISLGREQVPG		AREPRLMASC
HRASRVSIYD		NVPGSHLYAS		TGDLLDLEKD		DLFPHLDDIL		QHVNGLQEVV
DDWSKDVLPE		LQTHDTLVGE		PGLSTFPSPN		QITLDFEGNS		VSEGRTTPSD
VERDVTSLNE		SEPPGVRDRR		DSGVGASLTR		PNRRLRWNSF		QLSHQPRPAP
ASPHISSQTA		SQLSLLQRFS		LLRLTAIMEK		HSMSNKHGWT		WSVPKFMKRM
KVPDYKDKAV		FGVPLIVHVQ		RTGQPLPQSI		QQALRYLRSN		CLDQVGLFRK
SGVKSRIHAL		RQMNENFPEN		VNYEDQSAYD		VADMVKQFFR		DLPEPLFTNK
LSETFLHIYQ		YVSKEQRLQA		VQAAILLLAD		ENREVLQTLL		CFLNDVVNLV
EENQMTPMNL		AVCLAPSLFH		LNLLKKESSP		RVIQKKYATG		KPDQKDLNEN
LAAAQGLAHM		IMECDRLFEV		PHELVAQSRN		SYVEAEIHVP		TLEELGTQLE
ESGATFHTYL		NHLIQGLQKE		AKEKFKGWVT		CSSTDNTDLA		FKKVGDGNPL
KLWKASVEVE		APPSVVLNRV		LRERHLWDED		FVQWKVVETL		DRQTEIYQYV
LNSMAPHPSR		DFVVLRTWKT		DLPKGMCTLV		SLSVEHEEAQ		LLGGVRAVVM
DSQYLIEPCG		SGKSRLTHIC		RIDLKGHSPE		WYSKGFGHLC		AAEVARIRNS
FQPLIAEGPE		TKI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів гтфаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, мітохондрії, ліпідних краплях.

Література

• Nagaraja G.M., Kandpal R.P. (2004). Chromosome 13q12 encoded Rho GTPase activating protein suppresses growth of breast carcinoma cells, and yeast two-hybrid screen shows its interaction with several proteins. Biochem. Biophys. Res. Commun. 313: 654—665. PMID 14697242 DOI:10.1016/j.bbrc.2003.12.001
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 13