SUPT16H

SUPT16H
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 5E5B, 4Z2M, 4Z2N
Ідентифікатори
Символи	SUPT16H, CDC68, FACTP140, SPT16/CDC68, SPT16, SPT16 homolog, facilitates chromatin remodeling subunit, NEDDFAC
Зовнішні ІД	OMIM: 605012 MGI: 1890948 HomoloGene: 5207 GeneCards: SUPT16H
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleosome binding • GO:0031493 histone binding • RNA binding Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма • хромосома • FACT complex Біологічний процес • positive regulation of DNA-templated transcription, elongation • реплікація ДНК • nucleosome disassembly • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • GO:0100026 Репарація ДНК • transcription, DNA-templated • cellular response to DNA damage stimulus • regulation of signal transduction by p53 class mediator • transcription elongation from RNA polymerase II promoter • positive regulation of transcription elongation from RNA polymerase II promoter Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	11198	114741
Ensembl	ENSG00000092201	ENSMUSG00000035726
UniProt	Q9Y5B9	Q920B9
RefSeq (мРНК)	NM_007192	NM_033618
RefSeq (білок)	NP_009123	NP_291096
Локус (UCSC)	Хр. 14: 21.35 – 21.38 Mb	Хр. 14: 52.4 – 52.43 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SUPT16H (англ. SPT16 homolog, facilitates chromatin remodeling subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 047 амінокислот, а молекулярна маса — 119 914.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAVTLDKDAY		YRRVKRLYSN		WRKGEDEYAN		VDAIVVSVGV		DEEIVYAKST
ALQTWLFGYE		LTDTIMVFCD		DKIIFMASKK		KVEFLKQIAN		TKGNENANGA
PAITLLIREK		NESNKSSFDK		MIEAIKESKN		GKKIGVFSKD		KFPGEFMKSW
NDCLNKEGFD		KIDISAVVAY		TIAVKEDGEL		NLMKKAASIT		SEVFNKFFKE
RVMEIVDADE		KVRHSKLAES		VEKAIEEKKY		LAGADPSTVE		MCYPPIIQSG
GNYNLKFSVV		SDKNHMHFGA		ITCAMGIRFK		SYCSNLVRTL		MVDPSQEVQE
NYNFLLQLQE		ELLKELRHGV		KICDVYNAVM		DVVKKQKPEL		LNKITKNLGF
GMGIEFREGS		LVINSKNQYK		LKKGMVFSIN		LGFSDLTNKE		GKKPEEKTYA
LFIGDTVLVD		EDGPATVLTS		VKKKVKNVGI		FLKNEDEEEE		EEEKDEAEDL
LGRGSRAALL		TERTRNEMTA		EEKRRAHQKE		LAAQLNEEAK		RRLTEQKGEQ
QIQKARKSNV		SYKNPSLMPK		EPHIREMKIY		IDKKYETVIM		PVFGIATPFH
IATIKNISMS		VEGDYTYLRI		NFYCPGSALG		RNEGNIFPNP		EATFVKEITY
RASNIKAPGE		QTVPALNLQN		AFRIIKEVQK		RYKTREAEEK		EKEGIVKQDS
LVINLNRSNP		KLKDLYIRPN		IAQKRMQGSL		EAHVNGFRFT		SVRGDKVDIL
YNNIKHALFQ		PCDGEMIIVL		HFHLKNAIMF		GKKRHTDVQF		YTEVGEITTD
LGKHQHMHDR		DDLYAEQMER		EMRHKLKTAF		KNFIEKVEAL		TKEELEFEVP
FRDLGFNGAP		YRSTCLLQPT		SSALVNATEW		PPFVVTLDEV		ELIHFERVQF
HLKNFDMVIV		YKDYSKKVTM		INAIPVASLD		PIKEWLNSCD		LKYTEGVQSL
NWTKIMKTIV		DDPEGFFEQG		GWSFLEPEGE		GSDAEEGDSE		SEIEDETFNP
SEDDYEEEEE		DSDEDYSSEA		EESDYSKESL		GSEEESGKDW		DELEEEARKA
DRESRYEEEE		EQSRSMSRKR		KASVHSSGRG		SNRGSRHSSA		PPKKKRK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, пошкодження ДНК, репарація ДНК, реплікація ДНК. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література

• Orphanides G., Wu W.-H., Lane W.S., Hampsey M., Reinberg D. (1999). The chromatin-specific transcription elongation factor FACT comprises human SPT16 and SSRP1 proteins. Nature. 400: 284—288. PMID 10421373 DOI:10.1038/22350
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Kang S.-W., Kuzuhara T., Horikoshi M. (2000). Functional interaction of general transcription initiation factor TFIIE with general chromatin factor SPT16/CDC68. Genes Cells. 5: 251—263. PMID 10792464 DOI:10.1046/j.1365-2443.2000.00323.x
• Orphanides G., LeRoy G., Chang C.-H., Luse D.S., Reinberg D. (1998). FACT, a factor that facilitates transcript elongation through nucleosomes. Cell. 92: 105—116. PMID 9489704 DOI:10.1016/S0092-8674(00)80903-4
• LeRoy G., Orphanides G., Lane W.S., Reinberg D. (1998). Requirement of RSF and FACT for transcription of chromatin templates in vitro. Science. 282: 1900—1904. PMID 9836642 DOI:10.1126/science.282.5395.1900
• Keller D.M., Lu H. (2002). p53 serine 392 phosphorylation increases after UV through induction of the assembly of the CK2.hSPT16.SSRP1 complex. J. Biol. Chem. 277: 50206—50213. PMID 12393879 DOI:10.1074/jbc.M209820200

Див. також

• Хромосома 14