SV2C

SV2C
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4JRA, 5JLV
Ідентифікатори
Символи	SV2C, synaptic vesicle glycoprotein 2C
Зовнішні ІД	OMIM: 610291 MGI: 1922459 HomoloGene: 57152 GeneCards: SV2C
Онтологія гена Молекулярна функція • transporter activity • GO:0022891 transmembrane transporter activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • міжклітинні контакти • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • синапс • клітинна мембрана • Синаптичні бульбашки • мембрана • integral component of membrane • synaptic vesicle membrane • integral component of synaptic vesicle membrane • neuron projection Біологічний процес • neurotransmitter transport • трансмембранний транспорт • chemical synaptic transmission Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	22987	75209
Ensembl	ENSG00000122012	ENSMUSG00000051111
UniProt	Q496J9	Q69ZS6
RefSeq (мРНК)	NM_001297716 NM_014979	NM_029210
RefSeq (білок)	NP_001284645 NP_055794	NP_083486
Локус (UCSC)	Хр. 5: 76.08 – 76.35 Mb	Хр. 13: 96.09 – 96.27 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SV2C (англ. Synaptic vesicle glycoprotein 2C) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 5-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 727 амінокислот, а молекулярна маса — 82 342.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEDSYKDRTS		LMKGAKDIAR		EVKKQTVKKV		NQAVDRAQDE		YTQRSYSRFQ
DEEDDDDYYP		AGETYNGEAN		DDEGSSEATE		GHDEDDEIYE		GEYQGIPSMN
QAKDSIVSVG		QPKGDEYKDR		RELESERRAD		EEELAQQYEL		IIQECGHGRF
QWALFFVLGM		ALMADGVEVF		VVGFVLPSAE		TDLCIPNSGS		GWLGSIVYLG
MMVGAFFWGG		LADKVGRKQS		LLICMSVNGF		FAFLSSFVQG		YGFFLFCRLL
SGFGIGGAIP		TVFSYFAEVL		AREKRGEHLS		WLCMFWMIGG		IYASAMAWAI
IPHYGWSFSM		GSAYQFHSWR		VFVIVCALPC		VSSVVALTFM		PESPRFLLEV
GKHDEAWMIL		KLIHDTNMRA		RGQPEKVFTV		NKIKTPKQID		ELIEIESDTG
TWYRRCFVRI		RTELYGIWLT		FMRCFNYPVR		DNTIKLTIVW		FTLSFGYYGL
SVWFPDVIKP		LQSDEYALLT		RNVERDKYAN		FTINFTMENQ		IHTGMEYDNG
RFIGVKFKSV		TFKDSVFKSC		TFEDVTSVNT		YFKNCTFIDT		VFDNTDFEPY
KFIDSEFKNC		SFFHNKTGCQ		ITFDDDYSAY		WIYFVNFLGT		LAVLPGNIVS
ALLMDRIGRL		TMLGGSMVLS		GISCFFLWFG		TSESMMIGML		CLYNGLTISA
WNSLDVVTVE		LYPTDRRATG		FGFLNALCKA		AAVLGNLIFG		SLVSITKSIP
ILLASTVLVC		GGLVGLCLPD		TRTQVLM

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як транспорт. Локалізований у мембрані, клітинних контактах, цитоплазматичних везикулах, синапсах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 5