SVOP

SVOP
Ідентифікатори
Символи	SVOP, SV2 related protein
Зовнішні ІД	OMIM: 611699 MGI: 1915916 HomoloGene: 41283 GeneCards: SVOP
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0022891 transmembrane transporter activity Клітинна компонента • міжклітинні контакти • synaptic vesicle membrane • синапс • мембрана • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • integral component of membrane • Синаптичні бульбашки Біологічний процес • трансмембранний транспорт Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55530	68666
Ensembl	ENSG00000166111	ENSMUSG00000042078
UniProt	Q8N4V2	Q8BFT9
RefSeq (мРНК)	NM_018711	NM_026805 NM_001359214
RefSeq (білок)	NP_061181	NP_081081 NP_001346143
Локус (UCSC)	Хр. 12: 108.91 – 109.02 Mb	Хр. 5: 114.16 – 114.23 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SVOP (англ. SV2 related protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 12-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 548 амінокислот, а молекулярна маса — 60 769.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEEDLFQLRQ		LPVVKFRRTG		ESARSEDDTA		SGEHEVQIEG		VHVGLEAVEL
DDGAAVPKEF		ANPTDDTFMV		EDAVEAIGFG		KFQWKLSVLT		GLAWMADAME
MMILSILAPQ		LHCEWRLPSW		QVALLTSVVF		VGMMSSSTLW		GNISDQYGRK
TGLKISVLWT		LYYGILSAFA		PVYSWILVLR		GLVGFGIGGV		PQSVTLYAEF
LPMKARAKCI		LLIEVFWAIG		TVFEVVLAVF		VMPSLGWRWL		LILSAVPLLL
FAVLCFWLPE		SARYDVLSGN		QEKAIATLKR		IATENGAPMP		LGKLIISRQE
DRGKMRDLFT		PHFRWTTLLL		WFIWFSNAFS		YYGLVLLTTE		LFQAGDVCGI
SSRKKAVEAK		CSLACEYLSE		EDYMDLLWTT		LSEFPGVLVT		LWIIDRLGRK
KTMALCFVIF		SFCSLLLFIC		VGRNVLTLLL		FIARAFISGG		FQAAYVYTPE
VYPTATRALG		LGTCSGMARV		GALITPFIAQ		VMLESSVYLT		LAVYSGCCLL
AALASCFLPI		ETKGRGLQES		SHREWGQEMV		GRGMHGAGVT		RSNSGSQE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як транспорт. Локалізований у мембрані, клітинних контактах, цитоплазматичних везикулах, синапсах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Jacobsson J.A., Haitina T., Lindblom J., Fredriksson R. (2007). Identification of six putative human transporters with structural similarity to the drug transporter SLC22 family. Genomics. 90: 595—609. PMID 17714910 DOI:10.1016/j.ygeno.2007.03.017

Див. також

• Хромосома 12