SWAP70

SWAP70
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2DN6
Ідентифікатори
Символи	SWAP70, SWAP-70, HSPC321, SWAP switching B-cell complex 70kDa subunit, SWAP switching B-cell complex subunit 70, switching B-cell complex subunit switching B cell complex subunit SWAP70
Зовнішні ІД	OMIM: 604762 MGI: 1298390 HomoloGene: 7557 GeneCards: SWAP70
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • calcium ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • cadherin binding Клітинна компонента • cell projection • мембрана • клітинна мембрана • цитоскелет • клітинне ядро • lamellipodium • цитоплазма Біологічний процес • positive regulation of cytosolic calcium ion concentration • positive regulation of mast cell chemotaxis • negative regulation of peptidyl-serine dephosphorylation • negative regulation of actin filament depolymerization • actin filament bundle assembly • regulation of protein localization • regulation of actin polymerization or depolymerization • somatic cell DNA recombination • Перемикання класу імуноглобулінів • positive regulation of actin filament bundle assembly • negative regulation of cell-cell adhesion mediated by integrin Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23075	20947
Ensembl	ENSG00000133789	ENSMUSG00000031015
UniProt	Q9UH65	Q6A028
RefSeq (мРНК)	NM_001297714 NM_015055	NM_009302
RefSeq (білок)	NP_001284643 NP_055870	NP_033328
Локус (UCSC)	Хр. 11: 9.66 – 9.75 Mb	Хр. 7: 109.82 – 109.88 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SWAP70 (англ. SWAP switching B-cell complex subunit 70) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 585 амінокислот, а молекулярна маса — 68 998.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGSLKEELLK		AIWHAFTALD		QDHSGKVSKS		QLKVLSHNLC		TVLKVPHDPV
ALEEHFRDDD		EGPVSNQGYM		PYLNRFILEK		VQDNFDKIEF		NRMCWTLCVK
KNLTKNPLLI		TEEDAFKIWV		IFNFLSEDKY		PLIIVSEEIE		YLLKKLTEAM
GGGWQQEQFE		HYKINFDDSK		NGLSAWELIE		LIGNGQFSKG		MDRQTVSMAI
NEVFNELILD		VLKQGYMMKK		GHRRKNWTER		WFVLKPNIIS		YYVSEDLKDK
KGDILLDENC		CVESLPDKDG		KKCLFLVKCF		DKTFEISASD		KKKKQEWIQA
IHSTIHLLKL		GSPPPHKEAR		QRRKELRKKQ		LAEQEELERQ		MKELQAANES
KQQELEAVRK		KLEEAASRAA		EEEKKRLQTQ		VELQARFSTE		LEREKLIRQQ
MEEQVAQKSS		ELEQYLQRVR		ELEDMYLKLQ		EALEDERQAR		QDEETVRKLQ
ARLLEEESSK		RAELEKWHLE		QQQAIQTTEA		EKQELENQRV		LKEQALQEAM
EQLEQLELER		KQALEQYEEV		KKKLEMATNK		TKSWKDKVAH		HEGLIRLIEP
GSKNPHLITN		WGPAAFTEAE		LEEREKNWKE		KKTTE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, мембрані, клітинних відростках.

Література

• Rapalus L., Minegishi Y., Lavoie A., Cunningham-Rundles C., Conley M.E. (2001). Analysis of SWAP-70 as a candidate gene for non-X-linked hyper IgM syndrome and common variable immunodeficiency. Clin. Immunol. 101: 270—275. PMID 11726218 DOI:10.1006/clim.2001.5116
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 11