TDRD3

TDRD3
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1WJI, 2LTO, 3PMT, 3PNW, 3S6W
Ідентифікатори
Символи	TDRD3, tudor domain containing 3
Зовнішні ІД	OMIM: 614392 MGI: 2444023 HomoloGene: 12771 GeneCards: TDRD3
Онтологія гена Молекулярна функція • methylated histone binding • GO:0001105 transcription coactivator activity • chromatin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding Клітинна компонента • цитоплазма • exon-exon junction complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • комплекс Ґольджі • гіалоплазма Біологічний процес • regulation of nucleic acid-templated transcription • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • positive regulation of nucleic acid-templated transcription Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	81550	219249
Ensembl	ENSG00000083544	ENSMUSG00000022019
UniProt	Q9H7E2	Q91W18
RefSeq (мРНК)	NM_001146070 NM_001146071 NM_030794	NM_001253755 NM_172605
RefSeq (білок)	NP_001139542 NP_001139543 NP_110421	NP_001240684 NP_766193
Локус (UCSC)	Хр. 13: 60.4 – 60.57 Mb	Хр. 14: 87.65 – 87.78 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TDRD3 (англ. Tudor domain containing 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 651 амінокислот, а молекулярна маса — 73 185.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLRLQMTDGH		ISCTAVEFSY		MSKISLNTPP		GTKVKLSGIV		DIKNGFLLLN
DSNTTVLGGE		VEHLIEKWEL		QRSLSKHNRS		NIGTEGGPPP		FVPFGQKCVS
HVQVDSRELD		RRKTLQVTMP		VKPTNDNDEF		EKQRTAAIAE		VAKSKETKTF
GGGGGGARSN		LNMNAAGNRN		REVLQKEKST		KSEGKHEGVY		RELVDEKALK
HITEMGFSKE		ASRQALMDNG		NNLEAALNVL		LTSNKQKPVM		GPPLRGRGKG
RGRIRSEDEE		DLGNARPSAP		STLFDFLESK		MGTLNVEEPK		SQPQQLHQGQ
YRSSNTEQNG		VKDNNHLRHP		PRNDTRQPRN		EKPPRFQRDS		QNSKSVLEGS
GLPRNRGSER		PSTSSVSEVW		AEDRIKCDRP		YSRYDRTKDT		SYPLGSQHSD
GAFKKRDNSM		QSRSGKGPSF		AEAKENPLPQ		GSVDYNNQKR		GKRESQTSIP
DYFYDRKSQT		INNEAFSGIK		IEKHFNVNTD		YQNPVRSNSF		IGVPNGEVEM
PLKGRRIGPI		KPAGPVTAVP		CDDKIFYNSG		PKRRSGPIKP		EKILESSIPM
EYAKMWKPGD		ECFALYWEDN		KFYRAEVEAL		HSSGMTAVVK		FIDYGNYEEV
LLSNIKPIQT		EAWEEEGTYD		QTLEFRRGGD		GQPRRSTRPT		QQFYQPPRAR
N

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Goulet I., Boisvenue S., Mokas S., Mazroui R., Cote J. (2008). TDRD3, a novel Tudor domain-containing protein, localizes to cytoplasmic stress granules. Hum. Mol. Genet. 17: 3055—3074. PMID 18632687 DOI:10.1093/hmg/ddn203
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Cote J., Richard S. (2005). Tudor domains bind symmetrical dimethylated arginines. J. Biol. Chem. 280: 28476—28483. PMID 15955813 DOI:10.1074/jbc.M414328200

Див. також

• Хромосома 13