TGFBRAP1

TGFBRAP1
Ідентифікатори
Символи	TGFBRAP1, TRAP-1, TRAP1, VPS3, transforming growth factor beta receptor associated protein 1
Зовнішні ІД	OMIM: 606237 MGI: 2447427 HomoloGene: 3141 GeneCards: TGFBRAP1
Пов'язані генетичні захворювання
gestational hypertension, ожиріння, синдром набутого імунного дефіциту, Прееклампсія
Онтологія гена Молекулярна функція • transforming growth factor beta receptor binding • SMAD binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • CORVET complex • ендосома • early endosome • мембрана • внутрішньоклітинна мембранна органела Біологічний процес • protein transport • endosomal vesicle fusion • intracellular protein transport • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transforming growth factor beta receptor signaling pathway • vesicle-mediated transport • GO:0072468 сигнальна трансдукція • endosome to lysosome transport Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9392	73122
Ensembl	ENSG00000135966	ENSMUSG00000070939
UniProt	Q8WUH2	Q3UR70
RefSeq (мРНК)	NM_001142621 NM_004257 NM_001328646	NM_001013025 NM_001357299
RefSeq (білок)	NP_001136093 NP_001315575 NP_004248	NP_001013043 NP_001344228
Локус (UCSC)	Хр. 2: 105.26 – 105.33 Mb	Хр. 1: 43.09 – 43.14 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TGFBRAP1 (англ. Transforming growth factor beta receptor associated protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 2-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 860 амінокислот, а молекулярна маса — 97 158.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MMSIKAFTLV		SAVERELLMG		DKERVNIECV		ECCGRDLYVG		TNDCFVYHFL
LEERPVPAGP		ATFTATKQLQ		RHLGFKKPVN		ELRAASALNR		LLVLCDNSIS
LVNMLNLEPV		PSGARIKGAA		TFALNENPVS		GDPFCVEVCI		ISVKRRTIQM
FLVYEDRVQI		VKEVSTAEQP		LAVAVDGHFL		CLALTTQYII		HNYSTGVSQD
LFPYCSEERP		PIVKRIGRQE		FLLAGPGGLG		MFATVAGISQ		RAPVHWSENV
IGAAVSFPYV		IALDDEFITV		HSMLDQQQKQ		TLPFKEGHIL		QDFEGRVIVA
TSKGVYILVP		LPLEKQIQDL		LASRRVEEAL		VLAKGARRNI		PKEKFQVMYR
RILQQAGFIQ		FAQLQFLEAK		ELFRSGQLDV		RELISLYPFL		LPTSSSFTRS
HPPLHEYADL		NQLTQGDQEK		MAKCKRFLMS		YLNEVRSTEV		ANGYKEDIDT
ALLKLYAEAD		HDSLLDLLVT		ENFCLLTDSA		AWLEKHKKYF		ALGLLYHYNN
QDAAAVQLWV		NIVNGDVQDS		TRSDLYEYIV		DFLTYCLDEE		LVWAYADWVL
QKSEEVGVQV		FTKRPLDEQQ		KNSFNPDDII		NCLKKYPKAL		VKYLEHLVID
KRLQKEEYHT		HLAVLYLEEV		LLQRASASGK		GAEATETQAK		LRRLLQKSDL
YRVHFLLERL		QGAGLPMESA		ILHGKLGEHE		KALHILVHEL		QDFAAAEDYC
LWCSEGRDPP		HRQQLFHTLL		AIYLHAGPTA		HELAVAAVDL		LNRHATEFDA
AQVLQMLPDT		WSVQLLCPFL		MGAMRDSIHA		RRTMQVALGL		ARSENLIYTY
DKMKLKGSSI		QLSDKKLCQI		CQNPFCEPVF		VRYPNGGLVH		THCAASRHTN
PSSSSPGTRT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків. Локалізований у цитоплазмі, ендосомах.

Література

• Charng M.-J., Zhang D., Kinnunen P., Schneider M.D. (1998). A novel protein distinguishes between quiescent and activated forms of the type I transforming growth factor beta receptor. J. Biol. Chem. 273: 9365—9368. PMID 9545258 DOI:10.1074/jbc.273.16.9365
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Provost P., Samuelsson B., Radmark O. (1999). Interaction of 5-lipoxygenase with cellular proteins. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 96: 1881—1885. PMID 10051563 DOI:10.1073/pnas.96.5.1881
• Perini E.D., Schaefer R., Stoeter M., Kalaidzidis Y., Zerial M. (2014). Mammalian CORVET is required for fusion and conversion of distinct early endosome subpopulations. Traffic. 15: 1366—1389. PMID 25266290 DOI:10.1111/tra.12232

Див. також

• Хромосома 2