TIGAR

TIGAR
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3DCY
Ідентифікатори
Символи	TIGAR, FR2BP, C12orf5, TP53 induced glycolysis regulatory phosphatase
Зовнішні ІД	OMIM: 610775 MGI: 2442752 HomoloGene: 32473 GeneCards: TIGAR
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • каталітична активність • bisphosphoglycerate 2-phosphatase activity • hydrolase activity • fructose-2,6-bisphosphate 2-phosphatase activity Клітинна компонента • цитоплазма • внутрішньоклітинний • мітохондріальна зовнішня мембрана • мітохондрія • клітинне ядро • гіалоплазма Біологічний процес • regulation of response to DNA damage checkpoint signaling • negative regulation of glycolytic process • GO:1901555, GO:1905705 response to drug • intestinal epithelial cell development • positive regulation of cardiac muscle cell apoptotic process • GO:1900404 positive regulation of DNA repair • negative regulation of glucose catabolic process to lactate via pyruvate • cellular response to DNA damage stimulus • fructose 1,6-bisphosphate metabolic process • Автофагія • negative regulation of mitophagy • cellular response to cobalt ion • response to ischemia • fructose 2,6-bisphosphate metabolic process • regulation of pentose-phosphate shunt • negative regulation of programmed cell death • negative regulation of reactive oxygen species metabolic process • обмін речовин • response to gamma radiation • cellular response to hypoxia • positive regulation of hexokinase activity • negative regulation of neuron death • GO:0097285 апоптоз • GO:0098501, GO:0098502, GO:0006286 дефосфорилювання Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	57103	319801
Ensembl	ENSG00000078237	ENSMUSG00000038028
UniProt	Q9NQ88	Q8BZA9
RefSeq (мРНК)	NM_020375	NM_177003
RefSeq (білок)	NP_065108	NP_795977
Локус (UCSC)	Хр. 12: 4.31 – 4.36 Mb	Хр. 6: 127.06 – 127.09 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TIGAR (англ. TP53 induced glycolysis regulatory phosphatase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 270 амінокислот, а молекулярна маса — 30 063.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MARFALTVVR		HGETRFNKEK		IIQGQGVDEP		LSETGFKQAA		AAGIFLNNVK
FTHAFSSDLM		RTKQTMHGIL		ERSKFCKDMT		VKYDSRLRER		KYGVVEGKAL
SELRAMAKAA		REECPVFTPP		GGETLDQVKM		RGIDFFEFLC		QLILKEADQK
EQFSQGSPSN		CLETSLAEIF		PLGKNHSSKV		NSDSGIPGLA		ASVLVVSHGA
YMRSLFDYFL		TDLKCSLPAT		LSRSELMSVT		PNTGMSLFII		NFEEGREVKP
TVQCICMNLQ		DHLNGLTETR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до гідролаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, автофагія, ацетилювання. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, мітохондрії.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Jen K.Y., Cheung V.G. (2005). Identification of novel p53 target genes in ionizing radiation response. Cancer Res. 65: 7666—7673. PMID 16140933 DOI:10.1158/0008-5472.CAN-05-1039
• Bensaad K., Cheung E.C., Vousden K.H. (2009). Modulation of intracellular ROS levels by TIGAR controls autophagy. EMBO J. 28: 3015—3026. PMID 19713938 DOI:10.1038/emboj.2009.242
• Li H., Jogl G. (2009). Structural and biochemical studies of TIGAR (TP53-induced glycolysis and apoptosis regulator). J. Biol. Chem. 284: 1748—1754. PMID 19015259 DOI:10.1074/jbc.M807821200
• Wanka C., Steinbach J.P., Rieger J. (2012). Tp53-induced glycolysis and apoptosis regulator (TIGAR) protects glioma cells from starvation-induced cell death by up-regulating respiration and improving cellular redox homeostasis. J. Biol. Chem. 287: 33436—33446. PMID 22887998 DOI:10.1074/jbc.M112.384578
• Cheung E.C., Ludwig R.L., Vousden K.H. (2012). Mitochondrial localization of TIGAR under hypoxia stimulates HK2 and lowers ROS and cell death. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 109: 20491—20496. PMID 23185017 DOI:10.1073/pnas.1206530109

Див. також

• Хромосома 12