TNFAIP1

TNFAIP1
Ідентифікатори
Символи	TNFAIP1, B12, B61, BTBD34, EDP1, hBACURD2, TNF alpha induced protein 1
Зовнішні ІД	OMIM: 191161 MGI: 104961 HomoloGene: 22519 GeneCards: TNFAIP1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein domain specific binding • identical protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • ендосома • Cul3-RING ubiquitin ligase complex • ядерце • клітинне ядро Біологічний процес • positive regulation of DNA replication • реплікація ДНК • negative regulation of Rho protein signal transduction • protein homooligomerization • cell migration • Убіквітин-залежний протеоліз • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • stress fiber assembly • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • GO:0097285 апоптоз Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7126	21927
Ensembl	ENSG00000109079	ENSMUSG00000017615
UniProt	Q13829	O70479
RefSeq (мРНК)	NM_021137	NM_001159392 NM_009395
RefSeq (білок)	NP_066960	NP_001152864 NP_033421
Локус (UCSC)	Хр. 17: 28.34 – 28.35 Mb	Хр. 11: 78.41 – 78.43 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TNFAIP1 (англ. TNF alpha induced protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 316 амінокислот, а молекулярна маса — 36 204.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSGDTCLCPA		SGAKPKLSGF		KGGGLGNKYV		QLNVGGSLYY		TTVRALTRHD
TMLKAMFSGR		MEVLTDKEGW		ILIDRCGKHF		GTILNYLRDD		TITLPQNRQE
IKELMAEAKY		YLIQGLVNMC		QSALQDKKDS		YQPVCNIPII		TSLKEEERLI
ESSTKPVVKL		LYNRSNNKYS		YTSNSDDHLL		KNIELFDKLS		LRFNGRVLFI
KDVIGDEICC		WSFYGQGRKL		AEVCCTSIVY		ATEKKQTKVE		FPEARIYEET
LNVLLYETPR		VPDNSLLEAT		SRSRSQASPS		EDEETFELRD		RVRRIHVKRY
STYDDRQLGH		QSTHRD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, ендосомах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 17