TNPO3

TNPO3
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4C0O, 4C0P, 4C0Q, 4OL0
Ідентифікатори
Символи	TNPO3, IPO12, LGMD1F, MTR10A, TRN-SR, TRN-SR2, TRNSR, transportin 3, LGMDD2
Зовнішні ІД	OMIM: 610032 MGI: 1196412 HomoloGene: 40848 GeneCards: TNPO3
Пов'язані генетичні захворювання
системний червоний вовчак, autosomal dominant limb-girdle muscular dystrophy type 1F
Онтологія гена Молекулярна функція • nuclear localization sequence binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • signaling receptor activity • nuclear import signal receptor activity Клітинна компонента • цитоплазма • Ядерна мембрана • внутрішньоклітинна мембранна органела • клітинне ядро Біологічний процес • protein transport • GO:0072468 сигнальна трансдукція • protein import into nucleus • GO:0015915 транспорт Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23534	320938
Ensembl	ENSG00000064419	ENSMUSG00000012535
UniProt	Q9Y5L0	Q6P2B1
RefSeq (мРНК)	NM_001191028 NM_012470	NM_177296 NM_001347079 NM_001361290
RefSeq (білок)	NP_001177957 NP_036602 NP_001369145 NP_001369146 NP_001369147 NP_001369148 NP_001369149 NP_001369150 NP_001369151 NP_001369152 NP_036602.1	NP_001334008 NP_796270 NP_001348219
Локус (UCSC)	Хр. 7: 128.95 – 129.06 Mb	Хр. 6: 29.54 – 29.61 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TNPO3 (англ. Transportin 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 923 амінокислот, а молекулярна маса — 104 203.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEGAKPTLQL		VYQAVQALYH		DPDPSGKERA		SFWLGELQRS		VHAWEISDQL
LQIRQDVESC		YFAAQTMKMK		IQTSFYELPT		DSHASLRDSL		LTHIQNLKDL
SPVIVTQLAL		AIADLALQMP		SWKGCVQTLV		EKYSNDVTSL		PFLLEILTVL
PEEVHSRSLR		IGANRRTEII		EDLAFYSSTV		VSLLMTCVEK		AGTDEKMLMK
VFRCLGSWFN		LGVLDSNFMA		NNKLLALLFE		VLQQDKTSSN		LHEAASDCVC
SALYAIENVE		TNLPLAMQLF		QGVLTLETAY		HMAVAREDLD		KVLNYCRIFT
ELCETFLEKI		VCTPGQGLGD		LRTLELLLIC		AGHPQYEVVE		ISFNFWYRLG
EHLYKTNDEV		IHGIFKAYIQ		RLLHALARHC		QLEPDHEGVP		EETDDFGEFR
MRVSDLVKDL		IFLIGSMECF		AQLYSTLKEG		NPPWEVTEAV		LFIMAAIAKS
VDPENNPTLV		EVLEGVVRLP		ETVHTAVRYT		SIELVGEMSE		VVDRNPQFLD
PVLGYLMKGL		CEKPLASAAA		KAIHNICSVC		RDHMAQHFNG		LLEIARSLDS
FLLSPEAAVG		LLKGTALVLA		RLPLDKITEC		LSELCSVQVM		ALKKLLSQEP
SNGISSDPTV		FLDRLAVIFR		HTNPIVENGQ		THPCQKVIQE		IWPVLSETLN
KHRADNRIVE		RCCRCLRFAV		RCVGKGSAAL		LQPLVTQMVN		VYHVHQHSCF
LYLGSILVDE		YGMEEGCRQG		LLDMLQALCI		PTFQLLEQQN		GLQNHPDTVD
DLFRLATRFI		QRSPVTLLRS		QVVIPILQWA		IASTTLDHRD		ANCSVMRFLR
DLIHTGVAND		HEEDFELRKE		LIGQVMNQLG		QQLVSQLLHT		CCFCLPPYTL
PDVAEVLWEI		MQVDRPTFCR		WLENSLKGLP		KETTVGAVTV		THKQLTDFHK
QVTSAEECKQ		VCWALRDFTR		LFR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Kataoka N., Bachorik J.L., Dreyfuss G. (1999). Transportin-SR, a nuclear import receptor for SR proteins. J. Cell Biol. 145: 1145—1152. PMID 10366588 DOI:10.1083/jcb.145.6.1145
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Lai M.-C., Lin R.-I., Huang S.-Y., Tsai C.-W., Tarn W.-Y. (2000). A human importin-beta family protein, transportin-SR2, interacts with the phosphorylated RS domain of SR proteins. J. Biol. Chem. 275: 7950—7957. PMID 10713112 DOI:10.1074/jbc.275.11.7950
• Lai M.-C., Lin R.-I., Tarn W.-Y. (2001). Transportin-SR2 mediates nuclear import of phosphorylated SR proteins. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 98: 10154—10159. PMID 11517331 DOI:10.1073/pnas.181354098
• Lai M.-C., Kuo H.-W., Chang W.-C., Tarn W.-Y. (2003). A novel splicing regulator shares a nuclear import pathway with SR proteins. EMBO J. 22: 1359—1369. PMID 12628928 DOI:10.1093/emboj/cdg126

Див. також

• Хромосома 7