TNRC6B

TNRC6B
Ідентифікатори
Символи	TNRC6B, trinucleotide repeat containing 6B, trinucleotide repeat containing adaptor 6B, GDSBA
Зовнішні ІД	OMIM: 610740 MGI: 2443730 HomoloGene: 66194 GeneCards: TNRC6B
Пов'язані генетичні захворювання
рак простати, Фіброма
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • RNA binding Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • P-body • нуклеоплазма Біологічний процес • GO:0035194 РНК-інтерференція • positive regulation of nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening • regulation of translation • positive regulation of nuclear-transcribed mRNA catabolic process, deadenylation-dependent decay • Сайленсинг генів • miRNA-mediated gene silencing by inhibition of translation • Wnt signaling pathway, calcium modulating pathway • regulation of megakaryocyte differentiation • GO:1901313 positive regulation of gene expression • negative regulation of gene expression • gene silencing by miRNA Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23112	213988
Ensembl	ENSG00000100354	ENSMUSG00000047888
UniProt	Q9UPQ9	Q8BKI2
RefSeq (мРНК)	NM_015088 NM_001024843 NM_001162501	NM_144812 NM_177124
RefSeq (білок)	NP_001020014 NP_001155973 NP_055903	NP_659061 NP_796098
Локус (UCSC)	Хр. 22: 40.04 – 40.34 Mb	Хр. 15: 80.6 – 80.83 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TNRC6B (англ. Trinucleotide repeat containing 6B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 833 амінокислот, а молекулярна маса — 194 002.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MREKEQEREE		QLMEDKKRKK		EDKKKKEATQ		KVTEQKTKVP		EVTKPSLSQP
TAASPIGSSP		SPPVNGGNNA		KRVAVPNGQP		PSAARYMPRE		VPPRFRCQQD
HKVLLKRGQP		PPPSCMLLGG		GAGPPPCTAP		GANPNNAQVT		GALLQSESGT
APDSTLGGAA		ASNYANSTWG		SGASSNNGTS		PNPIHIWDKV		IVDGSDMEEW
PCIASKDTES		SSENTTDNNS		ASNPGSEKST		LPGSTTSNKG		KGSQCQSASS
GNECNLGVWK		SDPKAKSVQS		SNSTTENNNG		LGNWRNVSGQ		DRIGPGSGFS
NFNPNSNPSA		WPALVQEGTS		RKGALETDNS		NSSAQVSTVG		QTSREQQSKM
ENAGVNFVVS		GREQAQIHNT		DGPKNGNTNS		LNLSSPNPME		NKGMPFGMGL
GNTSRSTDAP		SQSTGDRKTG		SVGSWGAARG		PSGTDTVSGQ		SNSGNNGNNG
KEREDSWKGA		SVQKSTGSKN		DSWDNNNRST		GGSWNFGPQD		SNDNKWGEGN
KMTSGVSQGE		WKQPTGSDEL		KIGEWSGPNQ		PNSSTGAWDN		QKGHPLPENQ
GNAQAPCWGR		SSSSTGSEVG		GQSTGSNHKA		GSSDSHNSGR		RSYRPTHPDC
QAVLQTLLSR		TDLDPRVLSN		TGWGQTQIKQ		DTVWDIEEVP		RPEGKSDKGT
EGWESAATQT		KNSGGWGDAP		SQSNQMKSGW		GELSASTEWK		DPKNTGGWND
YKNNNSSNWG		GGRPDEKTPS		SWNENPSKDQ		GWGGGRQPNQ		GWSSGKNGWG
EEVDQTKNSN		WESSASKPVS		GWGEGGQNEI		GTWGNGGNAS		LASKGGWEDC
KRSPAWNETG		RQPNSWNKQH		QQQQPPQQPP		PPQPEASGSW		GGPPPPPPGN
VRPSNSSWSS		GPQPATPKDE		EPSGWEEPSP		QSISRKMDID		DGTSAWGDPN
SYNYKNVNLW		DKNSQGGPAP		REPNLPTPMT		SKSASVWSKS		TPPAPDNGTS
AWGEPNESSP		GWGEMDDTGA		STTGWGNTPA		NAPNAMKPNS		KSMQDGWGES
DGPVTGARHP		SWEEEEDGGV		WNTTGSQGSA		SSHNSASWGQ		GGKKQMKCSL
KGGNNDSWMN		PLAKQFSNMG		LLSQTEDNPS		SKMDLSVGSL		SDKKFDVDKR
AMNLGDFNDI		MRKDRSGFRP		PNSKDMGTTD		SGPYFEKLTL		PFSNQDGCLG
DEAPCSPFSP		SPSYKLSPSG		STLPNVSLGA		IGTGLNPQNF		AARQGGSHGL
FGNSTAQSRG		LHTPVQPLNS		SPSLRAQVPP		QFISPQVSAS		MLKQFPNSGL
SPGLFNVGPQ		LSPQQIAMLS		QLPQIPQFQL		ACQLLLQQQQ		QQQLLQNQRK
ISQAVRQQQE		QQLARMVSAL		QQQQQQQQRQ		PGMKHSPSHP		VGPKPHLDNM
VPNALNVGLP		DLQTKGPIPG		YGSGFSSGGM		DYGMVGGKEA		GTESRFKQWT
SMMEGLPSVA		TQEANMHKNG		AIVAPGKTRG		GSPYNQFDII		PGDTLGGHTG
PAGDSWLPAK		SPPTNKIGSK		SSNASWPPEF		QPGVPWKGIQ		NIDPESDPYV
TPGSVLGGTA		TSPIVDTDHQ		LLRDNTTGSN		SSLNTSLPSP		GAWPYSASDN
SFTNVHSTSA		KFPDYKSTWS		PDPIGHNPTH		LSNKMWKNHI		SSRNTTPLPR
PPPGLTNPKP		SSPWSSTAPR		SVRGWGTQDS		RLASASTWSD		GGSVRPSYWL
VLHNLTPQID		GSTLRTICMQ		HGPLLTFHLN		LTQGTALIRY		STKQEAAKAQ
TALHMCVLGN		TTILAEFATD		DEVSRFLAQA		QPPTPAATPS		APAAGWQSLE
TGQNQSDPVG		PALNLFGGST		GLGQWSSSAG		GSSGADLAGA		SLWGPPNYSS
SLWGVPTVED		PHRMGSPAPL		LPGDLLGGGS		DSI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як регуляція трансляції, РНК-залежне заглушення генів, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Zipprich J.T., Bhattacharyya S., Mathys H., Filipowicz W. (2009). Importance of the C-terminal domain of the human GW182 protein TNRC6C for translational repression. RNA. 15: 781—793. PMID 19304925 DOI:10.1261/rna.1448009
• Lazzaretti D., Tournier I., Izaurralde E. (2009). The C-terminal domains of human TNRC6A, TNRC6B, and TNRC6C silence bound transcripts independently of Argonaute proteins. RNA. 15: 1059—1066. PMID 19383768 DOI:10.1261/rna.1606309
• Braun J.E., Huntzinger E., Fauser M., Izaurralde E. (2011). GW182 proteins directly recruit cytoplasmic deadenylase complexes to miRNA targets. Mol. Cell. 44: 120—133. PMID 21981923 DOI:10.1016/j.molcel.2011.09.007

Див. також

• Хромосома 22