TONSL

TONSL
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 5JA4
Ідентифікатори
Символи	TONSL, IKBR, NFKBIL2, tonsoku-like, DNA repair protein, tonsoku like, DNA repair protein, SEMDSP
Зовнішні ІД	OMIM: 604546 MGI: 1919999 HomoloGene: 22754 GeneCards: TONSL
Пов'язані генетичні захворювання
spondyloepimetaphyseal dysplasia, Sponastrime type
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0031493 histone binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001106 transcription corepressor activity Клітинна компонента • цитоплазма • DNA replication factor A complex • nuclear replication fork • MCM complex • клітинне ядро • FACT complex • нуклеоплазма • ядерні тільця Біологічний процес • cytoplasmic sequestering of transcription factor • double-strand break repair via homologous recombination • replication fork processing • GO:0100026 Репарація ДНК • cellular response to DNA damage stimulus • negative regulation of nucleic acid-templated transcription Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	4796	72749
Ensembl	ENSG00000160949	ENSMUSG00000059323
UniProt	Q96HA7	Q6NZL6
RefSeq (мРНК)	NM_013432	NM_183091
RefSeq (білок)	NP_038460	NP_898914
Локус (UCSC)	Хр. 8: 144.43 – 144.44 Mb	Хр. 15: 76.51 – 76.52 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TONSL (англ. Tonsoku like, DNA repair protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 378 амінокислот, а молекулярна маса — 150 929.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSLERELRQL		SKAKAKAQRA		GQRREEAALC		HQLGELLAGH		GRYAEALEQH
WQELQLRERA		DDPLGCAVAH		RKIGERLAEM		EDYPAALQHQ		HQYLELAHSL
RNHTELQRAW		ATIGRTHLDI		YDHCQSRDAL		LQAQAAFEKS		LAIVDEELEG
TLAQGELNEM		RTRLYLNLGL		TFESLQQTAL		CNDYFRKSIF		LAEQNHLYED
LFRARYNLGT		IHWRAGQHSQ		AMRCLEGARE		CAHTMRKRFM		ESECCVVIAQ
VLQDLGDFLA		AKRALKKAYR		LGSQKPVQRA		AICQNLQHVL		AVVRLQQQLE
EAEGRDPQGA		MVICEQLGDL		FSKAGDFPRA		AEAYQKQLRF		AELLDRPGAE
RAIIHVSLAT		TLGDMKDHHG		AVRHYEEELR		LRSGNVLEEA		KTWLNIALSR
EEAGDAYELL		APCFQKALSC		AQQAQRPQLQ		RQVLQHLHTV		QLRLQPQEAP
ETETRLRELS		VAEDEDEEEE		AEEAAATAES		EALEAGEVEL		SEGEDDTDGL
TPQLEEDEEL		QGHLGRRKGS		KWNRRNDMGE		TLLHRACIEG		QLRRVQDLVR
QGHPLNPRDY		CGWTPLHEAC		NYGHLEIVRF		LLDHGAAVDD		PGGQGCEGIT
PLHDALNCGH		FEVAELLLER		GASVTLRTRK		GLSPLETLQQ		WVKLYRRDLD
LETRQKARAM		EMLLQAAASG		QDPHSSQAFH		TPSSLLFDPE		TSPPLSPCPE
PPSNSTRLPE		ASQAHVRVSP		GQAAPAMARP		RRSRHGPASS		SSSSEGEDSA
GPARPSQKRP		RCSATAQRVA		AWTPGPASNR		EAATASTSRA		AYQAAIRGVG
SAQSRLGPGP		PRGHSKALAP		QAALIPEEEC		LAGDWLELDM		PLTRSRRPRP
RGTGDNRRPS		STSGSDSEES		RPRARAKQVR		LTCMQSCSAP		VNAGPSSLAS
EPPGSPSTPR		VSEPSGDSSA		AGQPLGPAPP		PPIRVRVQVQ		DHLFLIPVPH
SSDTHSVAWL		AEQAAQRYYQ		TCGLLPRLTL		RKEGALLAPQ		DLIPDVLQSN
DEVLAEVTSW		DLPPLTDRYR		RACQSLGQGE		HQQVLQAVEL		QGLGLSFSAC
SLALDQAQLT		PLLRALKLHT		ALRELRLAGN		RLGDKCVAEL		VAALGTMPSL
ALLDLSSNHL		GPEGLRQLAM		GLPGQATLQS		LEELDLSMNP		LGDGCGQSLA
SLLHACPLLS		TLRLQACGFG		PSFFLSHQTA		LGSAFQDAEH		LKTLSLSYNA
LGAPALARTL		QSLPAGTLLH		LELSSVAAGK		GDSDLMEPVF		RYLAKEGCAL
AHLTLSANHL		GDKAVRDLCR		CLSLCPSLIS		LDLSANPEIS		CASLEELLST
LQKRPQGLSF		LGLSGCAVQG		PLGLGLWDKI		AAQLRELQLC		SRRLCAEDRD
ALRQLQPSRP		GPGECTLDHG		SKLFFRRL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, репарація ДНК, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Ray P., Zhang D.H., Elias J.A., Ray A. (1995). Cloning of a differentially expressed I kappa B-related protein. J. Biol. Chem. 270: 10680—10685. PMID 7738005 DOI:10.1074/jbc.270.18.10680
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Norman D.A., Barton P.J. (2000). Isolation, sequence, and chromosomal localisation of the human IkappaBR gene (NFKBIL2). Ann. Hum. Genet. 64: 15—23. PMID 11246458 DOI:10.1046/j.1469-1809.2000.6410015.x
• Ray P., Yang L., Zhang D.H., Ghosh S.K., Ray A. (1997). Selective up-regulation of cytokine-induced RANTES gene expression in lung epithelial cells by overexpression of IkappaBR. J. Biol. Chem. 272: 20191—20197. PMID 9242696 DOI:10.1074/jbc.272.32.20191

Див. також

• Хромосома 8