TOPBP1

TOPBP1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1WF6, 2XNH, 2XNK, 3AL2, 3AL3, 3JVE, 3OLC, 3PD7, 3UEN, 3UEO
Ідентифікатори
Символи	TOPBP1, TOP2BP1, topoisomerase (DNA) II binding protein 1, DNA topoisomerase II binding protein 1, Dpb11
Зовнішні ІД	OMIM: 607760 MGI: 1920018 HomoloGene: 38262 GeneCards: TOPBP1
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • protein C-terminus binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • isomerase activity Клітинна компонента • PML body • spindle pole • male germ cell nucleus • нуклеоплазма • центр організації мікротрубочок • хромосома • condensed nuclear chromosome • actin cytoskeleton • цитоскелет • клітинне ядро • цитоплазма • ядерні тільця Біологічний процес • response to ionizing radiation • DNA metabolic process • cellular response to DNA damage stimulus • GO:0100026 Репарація ДНК • DNA replication initiation • mitotic G2 DNA damage checkpoint signaling • mitotic DNA replication checkpoint signaling • реплікація ДНК • regulation of signal transduction by p53 class mediator Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	11073	235559
Ensembl	ENSG00000163781	ENSMUSG00000032555
UniProt	Q92547	Q6ZQF0
RefSeq (мРНК)	NM_007027 NM_001363889	NM_176979
RefSeq (білок)	NP_008958 NP_001350818 NP_008958.2	NP_795953
Локус (UCSC)	Хр. 3: 133.6 – 133.66 Mb	Хр. 9: 103.18 – 103.23 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TOPBP1 (англ. Topoisomerase (DNA) II binding protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 522 амінокислот, а молекулярна маса — 170 679.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSRNDKEPFF		VKFLKSSDNS		KCFFKALESI		KEFQSEEYLQ		IITEEEALKI
KENDRSLYIC		DPFSGVVFDH		LKKLGCRIVG		PQVVIFCMHH		QRCVPRAEHP
VYNMVMSDVT		ISCTSLEKEK		REEVHKYVQM		MGGRVYRDLN		VSVTHLIAGE
VGSKKYLVAA		NLKKPILLPS		WIKTLWEKSQ		EKKITRYTDI		NMEDFKCPIF
LGCIICVTGL		CGLDRKEVQQ		LTVKHGGQYM		GQLKMNECTH		LIVQEPKGQK
YECAKRWNVH		CVTTQWFFDS		IEKGFCQDES		IYKTEPRPEA		KTMPNSSTPT
SQINTIDSRT		LSDVSNISNI		NASCVSESIC		NSLNSKLEPT		LENLENLDVS
AFQAPEDLLD		GCRIYLCGFS		GRKLDKLRRL		INSGGGVRFN		QLNEDVTHVI
VGDYDDELKQ		FWNKSAHRPH		VVGAKWLLEC		FSKGYMLSEE		PYIHANYQPV
EIPVSHKPES		KAALLKKKNS		SFSKKDFAPS		EKHEQADEDL		LSQYENGSST
VVEAKTSEAR		PFNDSTHAEP		LNDSTHISLQ		EENQSSVSHC		VPDVSTITEE
GLFSQKSFLV		LGFSNENESN		IANIIKENAG		KIMSLLSRTV		ADYAVVPLLG
CEVEATVGEV		VTNTWLVTCI		DYQTLFDPKS		NPLFTPVPVM		TGMTPLEDCV
ISFSQCAGAE		KESLTFLANL		LGASVQEYFV		RKSNAKKGMF		ASTHLILKER
GGSKYEAAKK		WNLPAVTIAW		LLETARTGKR		ADESHFLIEN		STKEERSLET
EITNGINLNS		DTAEHPGTRL		QTHRKTVVTP		LDMNRFQSKA		FRAVVSQHAR
QVAASPAVGQ		PLQKEPSLHL		DTPSKFLSKD		KLFKPSFDVK		DALAALETPG
RPSQQKRKPS		TPLSEVIVKN		LQLALANSSR		NAVALSASPQ		LKEAQSEKEE
APKPLHKVVV		CVSKKLSKKQ		SELNGIAASL		GADYRWSFDE		TVTHFIYQGR
PNDTNREYKS		VKERGVHIVS		EHWLLDCAQE		CKHLPESLYP		HTYNPKMSLD
ISAVQDGRLC		NSRLLSAVSS		TKDDEPDPLI		LEENDVDNMA		TNNKESAPSN
GSGKNDSKGV		LTQTLEMREN		FQKQLQEIMS		ATSIVKPQGQ		RTSLSRSGCN
SASSTPDSTR		SARSGRSRVL		EALRQSRQTV		PDVNTEPSQN		EQIIWDDPTA
REERARLASN		LQWPSCPTQY		SELQVDIQNL		EDSPFQKPLH		DSEIAKQAVC
DPGNIRVTEA		PKHPISEELE		TPIKDSHLIP		TPQAPSIAFP		LANPPVAPHP
REKIITIEET		HEELKKQYIF		QLSSLNPQER		IDYCHLIEKL		GGLVIEKQCF
DPTCTHIVVG		HPLRNEKYLA		SVAAGKWVLH		RSYLEACRTA		GHFVQEEDYE
WGSSSILDVL		TGINVQQRRL		ALAAMRWRKK		IQQRQESGIV		EGAFSGWKVI
LHVDQSREAG		FKRLLQSGGA		KVLPGHSVPL		FKEATHLFSD		LNKLKPDDSG
VNIAEAAAQN		VYCLRTEYIA		DYLMQESPPH		VENYCLPEAI		SFIQNNKELG
TGLSQKRKAP		TEKNKIKRPR		VH

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як пошкодження ДНК, репарація ДНК, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, хромосомах.

Література

• Yamane K., Kawabata M., Tsuruo T. (1997). A DNA topoisomerase II binding protein with eight repeating regions similar to DNA repair enzymes and to a cell cycle regulator. Eur. J. Biochem. 250: 794—799. PMID 9461304 DOI:10.1111/j.1432-1033.1997.00794.x
• Yamane K., Tsuruo T. (1999). Conserved BRCT regions of TopBP1 and of the tumor suppressor BRCA1 bind strand breaks and termini of DNA. Oncogene. 18: 5194—5203. PMID 10498869 DOI:10.1038/sj.onc.1202922
• Liu K., Lin F.-T., Ruppert J.M., Lin W.-C. (2003). Regulation of E2F1 by BRCT domain-containing protein TopBP1. Mol. Cell. Biol. 23: 3287—3304. PMID 12697828 DOI:10.1128/MCB.23.9.3287-3304.2003
• Xu Z.-X., Timanova-Atanasova A., Zhao R.-X., Chang K.-S. (2003). PML colocalizes with and stabilizes the DNA damage response protein TopBP1. Mol. Cell. Biol. 23: 4247—4256. PMID 12773567 DOI:10.1128/MCB.23.12.4247-4256.2003
• Liu K., Luo Y., Lin F.-T., Lin W.-C. (2004). TopBP1 recruits Brg1/Brm to repress E2F1-induced apoptosis, a novel pRb-independent and E2F1-specific control for cell survival. Genes Dev. 18: 673—686. PMID 15075294 DOI:10.1101/gad.1180204
• Kumagai A., Lee J., Yoo H.Y., Dunphy W.G. (2006). TopBP1 activates the ATR-ATRIP complex. Cell. 124: 943—955. PMID 16530042 DOI:10.1016/j.cell.2005.12.041

Див. також

• Хромосома 3