TRA2B

TRA2B
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2CQC, 2KXN, 2RRA, 2RRB
Ідентифікатори
Символи	TRA2B, Htra2-beta, PPP1R156, SFRS10, SRFS10, TRA2-BETA, TRAN2B, transformer 2 beta homolog (Drosophila), transformer 2 beta homolog
Зовнішні ІД	OMIM: 602719 MGI: 106016 HomoloGene: 20965 GeneCards: TRA2B
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleic acid binding • mRNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • poly-purine tract binding • RNA binding • protein domain specific binding • pre-mRNA binding • identical protein binding Клітинна компонента • клітинне ядро • nuclear inner membrane • нуклеоплазма • spliceosomal complex • Рибонуклеопротеїни Біологічний процес • RNA splicing, via transesterification reactions • Сплайсинг РНК • cerebral cortex regionalization • mRNA processing • negative regulation of mRNA splicing, via spliceosome • embryonic brain development • mRNA splicing, via spliceosome • positive regulation of mRNA splicing, via spliceosome • regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome • regulation of RNA splicing • protein complex oligomerization • cellular response to glucose stimulus Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6434	20462
Ensembl	ENSG00000136527	ENSMUSG00000022858
UniProt	P62995	P62996
RefSeq (мРНК)	NM_001243879 NM_004593	NM_009186 NM_001330554 NM_001330555
RefSeq (білок)	NP_001230808 NP_004584	NP_001317483 NP_001317484 NP_033212
Локус (UCSC)	Хр. 3: 185.91 – 185.94 Mb	Хр. 16: 22.06 – 22.08 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TRA2B (англ. Transformer 2 beta homolog) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 288 амінокислот, а молекулярна маса — 33 666.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSDSGEQNYG		ERESRSASRS		GSAHGSGKSA		RHTPARSRSK		EDSRRSRSKS
RSRSESRSRS		RRSSRRHYTR		SRSRSRSHRR		SRSRSYSRDY		RRRHSHSHSP
MSTRRRHVGN		RANPDPNCCL		GVFGLSLYTT		ERDLREVFSK		YGPIADVSIV
YDQQSRRSRG		FAFVYFENVD		DAKEAKERAN		GMELDGRRIR		VDFSITKRPH
TPTPGIYMGR		PTYGSSRRRD		YYDRGYDRGY		DDRDYYSRSY		RGGGGGGGGW
RAAQDRDQIY		RRRSPSPYYS		RGGYRSRSRS		RSYSPRRY

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Nayler O., Cap C., Stamm S. (1998). Human transformer-2-beta gene (SFRS10): complete nucleotide sequence, chromosomal localization, and generation of a tissue-specific isoform. Genomics. 53: 191—202. PMID 9790768 DOI:10.1006/geno.1998.5471
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Tacke R., Tohyama M., Ogawa S., Manley J.L. (1998). Human Tra2 proteins are sequence-specific activators of pre-mRNA splicing. Cell. 93: 139—148. PMID 9546399 DOI:10.1016/S0092-8674(00)81153-8
• Eldridge A.G., Li Y., Sharp P.A., Blencowe B.J. (1999). The SRm160/300 splicing coactivator is required for exon-enhancer function. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 96: 6125—6130. PMID 10339552 DOI:10.1073/pnas.96.11.6125
• Hofmann Y., Wirth B. (2002). hnRNP-G promotes exon 7 inclusion of survival motor neuron (SMN) via direct interaction with Htra2-beta1. Hum. Mol. Genet. 11: 2037—2049. PMID 12165565 DOI:10.1093/hmg/11.17.2037
• Nasim M.T., Chernova T.K., Chowdhury H.M., Yue B.G., Eperon I.C. (2003). HnRNP G and Tra2beta: opposite effects on splicing matched by antagonism in RNA binding. Hum. Mol. Genet. 12: 1337—1348. PMID 12761049 DOI:10.1093/hmg/ddg136

Див. також

• Хромосома 3