TRAF4

TRAF4
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2EOD, 2YUC, 3ZJB, 4K8U, 4M4E
Ідентифікатори
Символи	TRAF4, CART1, MLN62, RNF83, TNF receptor associated factor 4
Зовнішні ІД	OMIM: 602464 MGI: 1202880 HomoloGene: 3173 GeneCards: TRAF4
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • WW domain binding • thioesterase binding • tumor necrosis factor receptor binding • protein kinase binding • ubiquitin protein ligase binding • identical protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • мембрана • bicellular tight junction • клітинна мембрана • міжклітинні контакти • perinuclear region of cytoplasm • цитоскелет • клітинне ядро • GO:0009327 protein-containing complex • внутрішньоклітинний Біологічний процес • regulation of apoptotic process • activation of NF-kappaB-inducing kinase activity • positive regulation of JNK cascade • positive regulation of protein homodimerization activity • respiratory gaseous exchange by respiratory system • multicellular organism development • respiratory tube development • GO:0072468 сигнальна трансдукція • positive regulation of protein kinase activity • GO:0097285 апоптоз Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9618	22032
Ensembl	ENSG00000076604	ENSMUSG00000017386
UniProt	Q9BUZ4	Q61382
RefSeq (мРНК)	NM_004295 NM_145751	NM_009423
RefSeq (білок)	NP_004286	NP_033449
Локус (UCSC)	Хр. 17: 28.74 – 28.75 Mb	Хр. 11: 78.05 – 78.06 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TRAF4 (англ. TNF receptor associated factor 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 470 амінокислот, а молекулярна маса — 53 543.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPGFDYKFLE		KPKRRLLCPL		CGKPMREPVQ		VSTCGHRFCD		TCLQEFLSEG
VFKCPEDQLP		LDYAKIYPDP		ELEVQVLGLP		IRCIHSEEGC		RWSGPLRHLQ
GHLNTCSFNV		IPCPNRCPMK		LSRRDLPAHL		QHDCPKRRLK		CEFCGCDFSG
EAYESHEGMC		PQESVYCENK		CGARMMRRLL		AQHATSECPK		RTQPCTYCTK
EFVFDTIQSH		QYQCPRLPVA		CPNQCGVGTV		AREDLPGHLK		DSCNTALVLC
PFKDSGCKHR		CPKLAMARHV		EESVKPHLAM		MCALVSRQRQ		ELQELRRELE
ELSVGSDGVL		IWKIGSYGRR		LQEAKAKPNL		ECFSPAFYTH		KYGYKLQVSA
FLNGNGSGEG		THLSLYIRVL		PGAFDNLLEW		PFARRVTFSL		LDQSDPGLAK
PQHVTETFHP		DPNWKNFQKP		GTWRGSLDES		SLGFGYPKFI		SHQDIRKRNY
VRDDAVFIRA		AVELPRKILS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, мембрані, клітинних контактах, щільних контактах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Fleckenstein D.S., Dirks W.G., Drexler H.G., Quentmeier H. (2003). Tumor necrosis factor receptor-associated factor (TRAF) 4 is a new binding partner for the p70S6 serine/threonine kinase. Leuk. Res. 27: 687—694. PMID 12801526 DOI:10.1016/S0145-2126(02)00325-9
• Abell A.N., Johnson G.L. (2005). MEKK4 is an effector of the embryonic TRAF4 for JNK activation. J. Biol. Chem. 280: 35793—35796. PMID 16157600 DOI:10.1074/jbc.C500260200

Див. також

• Хромосома 17