TRAIP

TRAIP
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4ZTD
Ідентифікатори
Символи	TRAIP, RNF206, TRIP, SCKL9, TRAF interacting protein
Зовнішні ІД	OMIM: 605958 MGI: 1096377 HomoloGene: 31343 GeneCards: TRAIP
Пов'язані генетичні захворювання
Seckel syndrome 9
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity • transferase activity • zinc ion binding Клітинна компонента • цитоплазма • perinuclear region of cytoplasm • ядерце • клітинне ядро Біологічний процес • проліферація • Убіквітин-залежний протеоліз • negative regulation of interferon-beta production • GO:0072468 сигнальна трансдукція • negative regulation of tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • GO:0097285 апоптоз • negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10293	22036
Ensembl	ENSG00000183763	ENSMUSG00000032586
UniProt	Q9BWF2	Q8VIG6
RefSeq (мРНК)	NM_005879	NM_011634
RefSeq (білок)	NP_005870	NP_035764
Локус (UCSC)	Хр. 3: 49.83 – 49.86 Mb	Хр. 9: 107.83 – 107.85 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TRAIP (англ. TRAF interacting protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 469 амінокислот, а молекулярна маса — 53 294.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPIRALCTIC		SDFFDHSRDV		AAIHCGHTFH		LQCLIQWFET		APSRTCPQCR
IQVGKRTIIN		KLFFDLAQEE		ENVLDAEFLK		NELDNVRAQL		SQKDKEKRDS
QVIIDTLRDT		LEERNATVVS		LQQALGKAEM		LCSTLKKQMK		YLEQQQDETK
QAQEEARRLR		SKMKTMEQIE		LLLQSQRPEV		EEMIRDMGVG		QSAVEQLAVY
CVSLKKEYEN		LKEARKASGE		VADKLRKDLF		SSRSKLQTVY		SELDQAKLEL
KSAQKDLQSA		DKEIMSLKKK		LTMLQETLNL		PPVASETVDR		LVLESPAPVE
VNLKLRRPSF		RDDIDLNATF		DVDTPPARPS		SSQHGYYEKL		CLEKSHSPIQ
DVPKKICKGP		RKESQLSLGG		QSCAGEPDEE		LVGAFPIFVR		NAILGQKQPK
RPRSESSCSK		DVVRTGFDGL		GGRTKFIQPT		DTVMIRPLPV		KPKTKVKQRV
RVKTVPSLFQ		AKLDTFLWS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до трансфераз. Задіяний у такому біологічному процесі як убіквітинування білків. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Lee S.Y., Lee S.Y., Choi Y. (1997). TRAF-interacting protein (TRIP): a novel component of the tumor necrosis factor receptor (TNFR)- and CD30-TRAF signaling complexes that inhibits TRAF2-mediated NF-kappaB activation. J. Exp. Med. 185: 1275—1285. PMID 9104814 DOI:10.1084/jem.185.7.1275
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 3