TRAPPC9

TRAPPC9
Ідентифікатори
Символи	TRAPPC9, IBP, IKBKBBP, MRT13, NIBP, TRS120, T1, trafficking protein particle complex 9, trafficking protein particle complex subunit 9
Зовнішні ІД	OMIM: 611966 MGI: 1923760 HomoloGene: 81931 GeneCards: TRAPPC9
Пов'язані генетичні захворювання
ожиріння, intellectual disability-obesity-brain malformations-facial dysmorphism syndrome, intellectual disability, autosomal recessive 13
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • trans-Golgi network • комплекс Ґольджі • ендоплазматичний ретикулум • Golgi membrane • TRAPP complex Біологічний процес • диференціація клітин • COPII vesicle coating • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity • neuron differentiation • cerebral cortex development Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	83696	76510
Ensembl	ENSG00000167632	ENSMUSG00000047921
UniProt	Q96Q05	Q3U0M1
RefSeq (мРНК)	NM_001160372 NM_031466 NM_001321646 NM_001374682 NM_001374683 NM_001374684	NM_001164641 NM_001164642 NM_001164643 NM_029640 NM_180662
RefSeq (білок)	NP_001153844 NP_001308575 NP_113654 NP_001361611 NP_001361612 NP_001361613	NP_001158113 NP_001158115 NP_083916 NP_850993
Локус (UCSC)	Хр. 8: 139.73 – 140.46 Mb	Хр. 15: 72.46 – 72.93 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TRAPPC9 (англ. Trafficking protein particle complex 9) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 148 амінокислот, а молекулярна маса — 128 530.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSVPDYMQCA		EDHQTLLVVV		QPVGIVSEEN		FFRIYKRICS		VSQISVRDSQ
RVLYIRYRHH		YPPENNEWGD		FQTHRKVVGL		ITITDCFSAK		DWPQTFEKFH
VQKEIYGSTL		YDSRLFVFGL		QGEIVEQPRT		DVAFYPNYED		CQTVEKRIED
FIESLFIVLE		SKRLDRATDK		SGDKIPLLCV		PFEKKDFVGL		DTDSRHYKKR
CQGRMRKHVG		DLCLQAGMLQ		DSLVHYHMSV		ELLRSVNDFL		WLGAALEGLC
SASVIYHYPG		GTGGKSGARR		FQGSTLPAEA		ANRHRPGAQE		VLIDPGALTT
NGINPDTSTE		IGRAKNCLSP		EDIIDKYKEA		ISYYSKYKNA		GVIELEACIK
AVRVLAIQKR		SMEASEFLQN		AVYINLRQLS		EEEKIQRYSI		LSELYELIGF
HRKSAFFKRV		AAMQCVAPSI		AEPGWRACYK		LLLETLPGYS		LSLDPKDFSR
GTHRGWAAVQ		MRLLHELVYA		SRRMGNPALS		VRHLSFLLQT		MLDFLSDQEK
KDVAQSLENY		TSKCPGTMEP		IALPGGLTLP		PVPFTKLPIV		RHVKLLNLPA
SLRPHKMKSL		LGQNVSTKSP		FIYSPIIAHN		RGEERNKKID		FQWVQGDVCE
VQLMVYNPMP		FELRVENMGL		LTSGVEFESL		PAALSLPAES		GLYPVTLVGV
PQTTGTITVN		GYHTTVFGVF		SDCLLDNLPG		IKTSGSTVEV		IPALPRLQIS
TSLPRSAHSL		QPSSGDEIST		NVSVQLYNGE		SQQLIIKLEN		IGMEPLEKLE
VTSKVLTTKE		KLYGDFLSWK		LEETLAQFPL		QPGKVATFTI		NIKVKLDFSC
QENLLQDLSD		DGISVSGFPL		SSPFRQVVRP		RVEGKPVNPP		ESNKAGDYSH
VKTLEAVLNF		KYSGGPGHTE		GYYRNLSLGL		HVEVEPSVFF		TRVSTLPATS
TRQCHLLLDV		FNSTEHELTV		STRSSEALIL		HAGECQRMAI		QVDKFNFESF
PESPGEKGQF		ANPKQLEEER		REARGLEIHS		KLGICWRIPS		LKRSGEASVE
GLLNQLVLEH		LQLAPLQWDV		LVDGQPCDRE		AVAACQVGDP		VRLEVRLTNR
SPRSVGPFAL		TVVPFQDHQN		GVHNYDLHDT		VSFVGSSTFY		LDAVQPSGQS
ACLGALLFLY		TGDFFLHIRF		HEDSTSKELP		PSWFCLPSVH		VCALEAQA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як диференціація клітин, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ендоплазматичному ретикулумі, апараті гольджі.

Література

• Nagase T., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XXI. The complete sequences of 60 new cDNA clones from brain which code for large proteins. DNA Res. 8: 179—187. PMID 11572484 DOI:10.1093/dnares/8.4.179
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 8