TRIM11

TRIM11
Ідентифікатори
Символи	TRIM11, BIA1, RNF92, tripartite motif containing 11
Зовнішні ІД	OMIM: 607868 MGI: 2137355 HomoloGene: 14225 GeneCards: TRIM11
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • zinc ion binding • transcription factor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein domain specific binding • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity • зв'язування з іоном металу • transferase activity Клітинна компонента • цитоплазма • внутрішньоклітинний • клітинне ядро • гіалоплазма Біологічний процес • negative regulation of neurogenesis • вроджений імунітет • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • defense response to virus • Убіквітин-залежний протеоліз • negative regulation of viral transcription • negative regulation of viral entry into host cell • positive regulation of viral entry into host cell Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	81559	94091
Ensembl	ENSG00000154370	ENSMUSG00000020455
UniProt	Q96F44	Q99PQ2
RefSeq (мРНК)	NM_145214	NM_001290988 NM_053168
RefSeq (білок)	NP_660215	NP_001277917 NP_444398
Локус (UCSC)	Хр. 1: 228.39 – 228.41 Mb	Хр. 11: 58.87 – 58.88 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TRIM11 (англ. Tripartite motif containing 11) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 468 амінокислот, а молекулярна маса — 52 774.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAAPDLSTNL		QEEATCAICL		DYFTDPVMTD		CGHNFCRECI		RRCWGQPEGP
YACPECRELS		PQRNLRPNRP		LAKMAEMARR		LHPPSPVPQG		VCPAHREPLA
AFCGDELRLL		CAACERSGEH		WAHRVRPLQD		AAEDLKAKLE		KSLEHLRKQM
QDALLFQAQA		DETCVLWQKM		VESQRQNVLG		EFERLRRLLA		EEEQQLLQRL
EEEELEVLPR		LREGAAHLGQ		QSAHLAELIA		ELEGRCQLPA		LGLLQDIKDA
LRRVQDVKLQ		PPEVVPMELR		TVCRVPGLVE		TLRRFRGDVT		LDPDTANPEL
ILSEDRRSVQ		RGDLRQALPD		SPERFDPGPC		VLGQERFTSG		RHYWEVEVGD
RTSWALGVCR		ENVNRKEKGE		LSAGNGFWIL		VFLGSYYNSS		ERALAPLRDP
PRRVGIFLDY		EAGHLSFYSA		TDGSLLFIFP		EIPFSGTLRP		LFSPLSSSPT
PMTICRPKGG		SGDTLAPQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як убіквітинування білків, антивірусний захист, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Ishikawa H., Tachikawa H., Miura Y., Takahashi N. (2006). TRIM11 binds to and destabilizes a key component of the activator-mediated cofactor complex (ARC105) through the ubiquitin-proteasome system. FEBS Lett. 580: 4784—4792. PMID 16904669 DOI:10.1016/j.febslet.2006.07.066
• Uchil P.D., Quinlan B.D., Chan W.T., Luna J.M., Mothes W. (2008). TRIM E3 ligases interfere with early and late stages of the retroviral life cycle. PLoS Pathog. 4: E16—E16. PMID 18248090 DOI:10.1371/journal.ppat.0040016

Див. також

• Хромосома 1