TRIM23

TRIM23
Ідентифікатори
Символи	TRIM23, ARD1, ARFD1, RNF46, tripartite motif containing 23
Зовнішні ІД	OMIM: 601747 MGI: 1933161 HomoloGene: 1251 GeneCards: TRIM23
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0010577 enzyme activator activity • identical protein binding • GO:0006184 GTPase activity • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GDP binding • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • nucleotide binding • GTP binding • transferase activity • nucleic acid binding Клітинна компонента • система ендомембран • Golgi membrane • клітинне ядро • lysosomal membrane • внутрішньоклітинний • мембрана • лізосома • цитоплазма • комплекс Ґольджі • клітинна мембрана Біологічний процес • Убіквітин-залежний протеоліз • GO:0022415 viral process • GO:0048554 positive regulation of catalytic activity • процес імунної системи • вроджений імунітет • intracellular protein transport • Golgi to plasma membrane transport • vesicle-mediated transport Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	373	81003
Ensembl	ENSG00000113595	ENSMUSG00000021712
UniProt	P36406	Q8BGX0
RefSeq (мРНК)	NM_001656 NM_033227 NM_033228	NM_030731 NM_001361538 NM_001361539
RefSeq (білок)	NP_001647 NP_150230 NP_150231	NP_001348467 NP_001348468
Локус (UCSC)	Хр. 5: 65.59 – 65.63 Mb	Хр. 13: 104.32 – 104.34 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TRIM23 (англ. Tripartite motif containing 23) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 574 амінокислот, а молекулярна маса — 64 067.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MATLVVNKLG		AGVDSGRQGS		RGTAVVKVLE		CGVCEDVFSL		QGDKVPRLLL
CGHTVCHDCL		TRLPLHGRAI		RCPFDRQVTD		LGDSGVWGLK		KNFALLELLE
RLQNGPIGQY		GAAEESIGIS		GESIIRCDED		EAHLASVYCT		VCATHLCSEC
SQVTHSTKTL		AKHRRVPLAD		KPHEKTMCSQ		HQVHAIEFVC		LEEGCQTSPL
MCCVCKEYGK		HQGHKHSVLE		PEANQIRASI		LDMAHCIRTF		TEEISDYSRK
LVGIVQHIEG		GEQIVEDGIG		MAHTEHVPGT		AENARSCIRA		YFYDLHETLC
RQEEMALSVV		DAHVREKLIW		LRQQQEDMTI		LLSEVSAACL		HCEKTLQQDD
CRVVLAKQEI		TRLLETLQKQ		QQQFTEVADH		IQLDASIPVT		FTKDNRVHIG
PKMEIRVVTL		GLDGAGKTTI		LFKLKQDEFM		QPIPTIGFNV		ETVEYKNLKF
TIWDVGGKHK		LRPLWKHYYL		NTQAVVFVVD		SSHRDRISEA		HSELAKLLTE
KELRDALLLI		FANKQDVAGA		LSVEEITELL		SLHKLCCGRS		WYIQGCDARS
GMGLYEGLDW		LSRQLVAAGV		LDVA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до трансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах як взаємодія хазяїн-вірус, убіквітинування білків, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, іонами металів, іоном цинку, ГТФ. Локалізований у мембрані, лізосомі, апараті гольджі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Vitale N., Horiba K., Ferrans V.J., Moss J., Vaughan M. (1998). Localization of ADP-ribosylation factor domain protein 1 (ARD1) in lysosomes and Golgi apparatus. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 95: 8613—8618. PMID 9671726 DOI:10.1073/pnas.95.15.8613
• Vichi A., Payne D.M., Pacheco-Rodriguez G., Moss J., Vaughan M. (2005). E3 ubiquitin ligase activity of the trifunctional ARD1 (ADP-ribosylation factor domain protein 1). Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 102: 1945—1950. PMID 15684077 DOI:10.1073/pnas.0409800102
• Mishima K., Tsuchiya M., Nightingale M.S., Moss J., Vaughan M. (1993). ARD 1, a 64-kDa guanine nucleotide-binding protein with a carboxyl-terminal ADP-ribosylation factor domain. J. Biol. Chem. 268: 8801—8807. PMID 8473324

Див. також

• Хромосома 5