TRIM37

TRIM37
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3LRQ
Ідентифікатори
Символи	TRIM37, MUL, POB1, TEF3, tripartite motif containing 37
Зовнішні ІД	OMIM: 605073 MGI: 2153072 HomoloGene: 9084 GeneCards: TRIM37
Пов'язані генетичні захворювання
mulibrey nanism
Онтологія гена Молекулярна функція • protein homodimerization activity • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity • zinc ion binding • chromatin binding • зв'язування з іоном металу • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • tumor necrosis factor receptor binding • ubiquitin protein ligase binding • transferase activity Клітинна компонента • гіалоплазма • ESC/E(Z) complex • внутрішньоклітинний • aggresome • perinuclear region of cytoplasm • пероксисома • цитоплазма Біологічний процес • negative regulation of centriole replication • positive regulation of DNA-binding transcription factor activity • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity • Убіквітин-залежний протеоліз • negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity • aggresome assembly • protein autoubiquitination • histone H2A monoubiquitination • histone H2A-K119 monoubiquitination Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	4591	68729
Ensembl	ENSG00000108395	ENSMUSG00000018548
UniProt	O94972	Q6PCX9
RefSeq (мРНК)	NM_001005207 NM_015294 NM_001320987 NM_001320988 NM_001320989 NM_001320990 NM_001353082 NM_001353083 NM_001353084 NM_001353085 NM_001353086	NM_197987 NM_001363025 NM_001363026 NM_001363027 NM_001363028
RefSeq (білок)	NP_001005207 NP_001307916 NP_001307917 NP_001307918 NP_001307919 NP_056109 NP_001340011 NP_001340012 NP_001340013 NP_001340014 NP_001340015	NP_932104 NP_001349954 NP_001349955 NP_001349956 NP_001349957
Локус (UCSC)	Хр. 17: 58.98 – 59.11 Mb	Хр. 11: 87.02 – 87.11 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TRIM37 (англ. Tripartite motif containing 37) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 964 амінокислот, а молекулярна маса — 107 906.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDEQSVESIA		EVFRCFICME		KLRDARLCPH		CSKLCCFSCI		RRWLTEQRAQ
CPHCRAPLQL		RELVNCRWAE		EVTQQLDTLQ		LCSLTKHEEN		EKDKCENHHE
KLSVFCWTCK		KCICHQCALW		GGMHGGHTFK		PLAEIYEQHV		TKVNEEVAKL
RRRLMELISL		VQEVERNVEA		VRNAKDERVR		EIRNAVEMMI		ARLDTQLKNK
LITLMGQKTS		LTQETELLES		LLQEVEHQLR		SCSKSELISK		SSEILMMFQQ
VHRKPMASFV		TTPVPPDFTS		ELVPSYDSAT		FVLENFSTLR		QRADPVYSPP
LQVSGLCWRL		KVYPDGNGVV		RGYYLSVFLE		LSAGLPETSK		YEYRVEMVHQ
SCNDPTKNII		REFASDFEVG		ECWGYNRFFR		LDLLANEGYL		NPQNDTVILR
FQVRSPTFFQ		KSRDQHWYIT		QLEAAQTSYI		QQINNLKERL		TIELSRTQKS
RDLSPPDNHL		SPQNDDALET		RAKKSACSDM		LLEGGPTTAS		VREAKEDEED
EEKIQNEDYH		HELSDGDLDL		DLVYEDEVNQ		LDGSSSSASS		TATSNTEEND
IDEETMSGEN		DVEYNNMELE		EGELMEDAAA		AGPAGSSHGY		VGSSSRISRR
THLCSAATSS		LLDIDPLILI		HLLDLKDRSS		IENLWGLQPR		PPASLLQPTA
SYSRKDKDQR		KQQAMWRVPS		DLKMLKRLKT		QMAEVRCMKT		DVKNTLSEIK
SSSAASGDMQ		TSLFSADQAA		LAACGTENSG		RLQDLGMELL		AKSSVANCYI
RNSTNKKSNS		PKPARSSVAG		SLSLRRAVDP		GENSRSKGDC		QTLSEGSPGS
SQSGSRHSSP		RALIHGSIGD		ILPKTEDRQC		KALDSDAVVV		AVFSGLPAVE
KRRKMVTLGA		NAKGGHLEGL		QMTDLENNSE		TGELQPVLPE		GASAAPEEGM
SSDSDIECDT		ENEEQEEHTS		VGGFHDSFMV		MTQPPDEDTH		SSFPDGEQIG
PEDLSFNTDE		NSGR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, убіквітинування білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, пероксисомах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Kallijarvi J., Avela K., Lipsanen-Nyman M., Ulmanen I., Lehesjoki A.E. (2002). The TRIM37 gene encodes a peroxisomal RING-B-box-coiled-coil protein: classification of mulibrey nanism as a new peroxisomal disorder. Am. J. Hum. Genet. 70: 1215—1228. PMID 11938494 DOI:10.1086/340256
• Hamalainen R.H., Joensuu T., Kallijarvi J., Lehesjoki A.E. (2006). Characterisation of the mulibrey nanism-associated TRIM37 gene: transcription initiation, promoter region and alternative splicing. Gene. 366: 180—188. PMID 16310976 DOI:10.1016/j.gene.2005.08.008
• Balestra F.R., Strnad P., Fluckiger I., Gonczy P. (2013). Discovering regulators of centriole biogenesis through siRNA-based functional genomics in human cells. Dev. Cell. 25: 555—571. PMID 23769972 DOI:10.1016/j.devcel.2013.05.016
• Kumpf M., Hamalainen R.H., Hofbeck M., Baden W. (2013). Refractory congestive heart failure following delayed pericardectomy in a 12-year-old child with Mulibrey nanism due to a novel mutation in TRIM37. Eur. J. Pediatr. 172: 1415—1418. PMID 23385855 DOI:10.1007/s00431-013-1962-2
• Tabah A.A., Tardif K., Mansky L.M. (2014). Anti-HIV-1 activity of Trim 37. J. Gen. Virol. 95: 960—967. PMID 24317724 DOI:10.1099/vir.0.057653-0

Див. також

• Хромосома 17