TRIM41

TRIM41
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2EGM
Ідентифікатори
Символи	TRIM41, RINCK, tripartite motif containing 41
Зовнішні ІД	OMIM: 610530 MGI: 2384814 HomoloGene: 14140 GeneCards: TRIM41
Онтологія гена Молекулярна функція • zinc ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • identical protein binding • transferase activity Клітинна компонента • цитоплазма • ядерце • внутрішньоклітинний • клітинне ядро • ядерні тільця Біологічний процес • Убіквітин-залежний протеоліз • cellular response to lipopolysaccharide • cellular response to muramyl dipeptide Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	90933	211007
Ensembl	ENSG00000146063	ENSMUSG00000040365
UniProt	Q8WV44	Q5NCC3
RefSeq (мРНК)	NM_033549 NM_201627	NM_145377
RefSeq (білок)	NP_291027 NP_963921	NP_663352
Локус (UCSC)	Хр. 5: 181.22 – 181.24 Mb	Хр. 11: 48.7 – 48.71 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TRIM41 (англ. Tripartite motif containing 41) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 630 амінокислот, а молекулярна маса — 71 670.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAAVAMTPNP		VQTLQEEAVC		AICLDYFTDP		VSIGCGHNFC		RVCVTQLWGG
EDEEDRDELD		REEEEEDGEE		EEVEAVGAGA		GWDTPMRDED		YEGDMEEEVE
EEEEGVFWTS		GMSRSSWDNM		DYVWEEEDEE		EDLDYYLGDM		EEEDLRGEDE
EDEEEVLEEV		EEEDLDPVTP		LPPPPAPRRC		FTCPQCRKSF		PRRSFRPNLQ
LANMVQVIRQ		MHPTPGRGSR		VTDQGICPKH		QEALKLFCEV		DEEAICVVCR
ESRSHKQHSV		VPLEEVVQEY		KAKLQGHVEP		LRKHLEAVQK		MKAKEERRVT
ELKSQMKSEL		AAVASEFGRL		TRFLAEEQAG		LERRLREMHE		AQLGRAGAAA
SRLAEQAAQL		SRLLAEAQER		SQQGGLRLLQ		DIKETFNRCE		EVQLQPPEVW
SPDPCQPHSH		DFLTDAIVRK		MSRMFCQAAR		VDLTLDPDTA		HPALMLSPDR
RGVRLAERRQ		EVADHPKRFS		ADCCVLGAQG		FRSGRHYWEV		EVGGRRGWAV
GAARESTHHK		EKVGPGGSSV		GSGDASSSRH		HHRRRRLHLP		QQPLLQREVW
CVGTNGKRYQ		AQSSTEQTLL		SPSEKPRRFG		VYLDYEAGRL		GFYNAETLAH
VHTFSAAFLG		ERVFPFFRVL		SKGTRIKLCP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Tanaka M., Fukuda Y., Mashima K., Hanai R. (2005). Intracellular localization and domain organization of human TRIM41 proteins. Mol. Biol. Rep. 32: 87—93. PMID 16022281 DOI:10.1007/s11033-004-6613-2
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Kobayashi M., Hanai R. (2001). M phase-specific association of human topoisomerase IIIbeta with chromosomes. Biochem. Biophys. Res. Commun. 287: 282—287. PMID 11549288 DOI:10.1006/bbrc.2001.5580

Див. також

• Хромосома 5