TRIM45

TRIM45
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2DS4
Ідентифікатори
Символи	TRIM45, RNF99, tripartite motif containing 45
Зовнішні ІД	OMIM: 609318 MGI: 1918187 HomoloGene: 11865 GeneCards: TRIM45
Онтологія гена Молекулярна функція • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу Клітинна компонента • внутрішньоклітинний • клітинне ядро • нуклеоплазма • intercellular bridge • цитоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • bone development Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	80263	229644
Ensembl	ENSG00000134253	ENSMUSG00000033233
UniProt	Q9H8W5	Q6PFY8
RefSeq (мРНК)	NM_001145635 NM_025188	NM_001165952 NM_001165953 NM_194343
RefSeq (білок)	NP_001139107 NP_079464	NP_001159424 NP_001159425 NP_919324
Локус (UCSC)	Хр. 1: 117.11 – 117.12 Mb	Хр. 3: 100.83 – 100.84 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TRIM45 (англ. Tripartite motif containing 45) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 580 амінокислот, а молекулярна маса — 64 359.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSENRKPLLG		FVSKLTSGTA		LGNSGKTHCP		LCLGLFKAPR		LLPCLHTVCT
TCLEQLEPFS		VVDIRGGDSD		TSSEGSIFQE		LKPRSLQSQI		GILCPVCDAQ
VDLPMGGVKA		LTIDHLAVND		VMLESLRGEG		QGLVCDLCND		REVEKRCQTC
KANLCHFCCQ		AHRRQKKTTY		HTMVDLKDLK		GYSRIGKPIL		CPVHPAEELR
LFCEFCDRPV		CQDCVVGEHR		EHPCDFTSNV		IHKHGDSVWE		LLKGTQPHVE
ALEEALAQIH		IINSALQKRV		EAVAADVRTF		SEGYIKAIEE		HRDKLLKQLE
DIRAQKENSL		QLQKAQLEQL		LADMRTGVEF		TEHLLTSGSD		LEILITKRVV
VERLRKLNKV		QYSTRPGVND		KIRFCPQEKA		GQCRGYEIYG		TINTKEVDPA
KCVLQGEDLH		RAREKQTASF		TLLCKDAAGE		IMGRGGDNVQ		VAVVPKDKKD
SPVRTMVQDN		KDGTYYISYT		PKEPGVYTVW		VCIKEQHVQG		SPFTVMVRRK
HRPHSGVFHC		CTFCSSGGQK		TARCACGGTM		PGGYLGCGHG		HKGHPGHPHW
SCCGKFNEKS		ECTWTGGQSA		PRSLLRTVAL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 1