TRIM55

TRIM55
Ідентифікатори
Символи	TRIM55, MURF-2, RNF29, muRF2, tripartite motif containing 55
Зовнішні ІД	OMIM: 606469 MGI: 3036269 HomoloGene: 13205 GeneCards: TRIM55
Онтологія гена Молекулярна функція • zinc ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • signal transducer activity • зв'язування з іоном металу • identical protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • мікротрубочка • внутрішньоклітинний • клітинне ядро Біологічний процес • GO:0072468 сигнальна трансдукція Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	84675	381485
Ensembl	ENSG00000147573	ENSMUSG00000060913
UniProt	Q9BYV6	G3X8Y1
RefSeq (мРНК)	NM_033058 NM_184085 NM_184086 NM_184087	NM_001081281
RefSeq (білок)	NP_149047 NP_908973 NP_908974 NP_908975	NP_001074750
Локус (UCSC)	Хр. 8: 66.13 – 66.18 Mb	Хр. 3: 19.7 – 19.75 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TRIM55 (англ. Tripartite motif containing 55) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 548 амінокислот, а молекулярна маса — 60 466.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSASLNYKSF		SKEQQTMDNL		EKQLICPICL		EMFTKPVVIL		PCQHNLCRKC
ASDIFQASNP		YLPTRGGTTM		ASGGRFRCPS		CRHEVVLDRH		GVYGLQRNLL
VENIIDIYKQ		ESTRPEKKSD		QPMCEEHEEE		RINIYCLNCE		VPTCSLCKVF
GAHKDCQVAP		LTHVFQRQKS		ELSDGIAILV		GSNDRVQGVI		SQLEDTCKTI
EECCRKQKQE		LCEKFDYLYG		ILEERKNEMT		QVITRTQEEK		LEHVRALIKK
YSDHLENVSK		LVESGIQFMD		EPEMAVFLQN		AKTLLKKISE		ASKAFQMEKI
EHGYENMNHF		TVNLNREEKI		IREIDFYRED		EDEEEEEGGE		GEKEGEGEVG
GEAVEVEEVE		NVQTEFPGED		ENPEKASELS		QVELQAAPGA		LPVSSPEPPP
ALPPAADAPV		TQGEVVPTGS		EQTTESETPV		PAAAETADPL		FYPSWYKGQT
RKATTNPPCT		PGSEGLGQIG		PPGSEDSNVR		KAEVAAAAAS		ERAAVSGKET
SAPAATSQIG		FEAPPLQGQA		AAPASGSGAD		SEPARHIFSF		SWLNSLNE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до м'язових білків. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 8