TRIM69

TRIM69
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4NQJ
Ідентифікатори
Символи	TRIM69, HSD-34, HSD34, RNF36, Trif, tripartite motif containing 69
Зовнішні ІД	OMIM: 616017 MGI: 1918178 HomoloGene: 18827 GeneCards: TRIM69
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • transferase activity Клітинна компонента • цитоплазма • nuclear speck • клітинне ядро • гіалоплазма Біологічний процес • Убіквітин-залежний протеоліз • GO:0097285 апоптоз • protein polyubiquitination Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	140691	70928
Ensembl	ENSG00000278211 ENSG00000185880	ENSMUSG00000033368
UniProt	Q86WT6	Q80X56
RefSeq (мРНК)	NM_182985 NM_001301144 NM_001301145 NM_001301146 NM_080745	NM_080510 NM_001379369
RefSeq (білок)	NP_001288073 NP_001288074 NP_001288075 NP_542783 NP_892030	NP_536771 NP_001366298
Локус (UCSC)	Хр. 15: 44.73 – 44.77 Mb	Хр. 2: 121.99 – 122.01 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TRIM69 (англ. Tripartite motif containing 69) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 500 амінокислот, а молекулярна маса — 57 419.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEVSTNPSSN		IDPGDYVEMN		DSITHLPSKV		VIQDITMELH		CPLCNDWFRD
PLMLSCGHNF		CEACIQDFWR		LQAKETFCPE		CKMLCQYNNC		TFNPVLDKLV
EKIKKLPLLK		GHPQCPEHGE		NLKLFSKPDG		KLICFQCKDA		RLSVGQSKEF
LQISDAVHFF		TEELAIQQGQ		LETTLKELQT		LRNMQKEAIA		AHKENKLHLQ
QHVSMEFLKL		HQFLHSKEKD		ILTELREEGK		ALNEEMELNL		SQLQEQCLLA
KDMLVSIQAK		TEQQNSFDFL		KDITTLLHSL		EQGMKVLATR		ELISRKLNLG
QYKGPIQYMV		WREMQDTLCP		GLSPLTLDPK		TAHPNLVLSK		SQTSVWHGDI
KKIMPDDPER		FDSSVAVLGS		RGFTSGKWYW		EVEVAKKTKW		TVGVVRESII
RKGSCPLTPE		QGFWLLRLRN		QTDLKALDLP		SFSLTLTNNL		DKVGIYLDYE
GGQLSFYNAK		TMTHIYTFSN		TFMEKLYPYF		CPCLNDGGEN		KEPLHILHPQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Han Y., Li R., Gao J., Miao S., Wang L. (2012). Characterisation of human RING finger protein TRIM69, a novel testis E3 ubiquitin ligase and its subcellular localisation. Biochem. Biophys. Res. Commun. 429: 6—11. PMID 23131556 DOI:10.1016/j.bbrc.2012.10.109

Див. також

• Хромосома 15