TRIM72

TRIM72
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3KB5
Ідентифікатори
Символи	TRIM72, MG53, tripartite motif containing 72
Зовнішні ІД	OMIM: 613288 MGI: 3612190 HomoloGene: 66924 GeneCards: TRIM72
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity • zinc ion binding • phosphatidylserine binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ubiquitin conjugating enzyme binding Клітинна компонента • мембрана • клітинна мембрана • внутрішньоклітинний • Сарколема • cytoplasmic vesicle membrane • GO:0016023 cytoplasmic vesicle Біологічний процес • м'язове скорочення • muscle organ development • plasma membrane repair • GO:1903105 negative regulation of insulin receptor signaling pathway • Убіквітин-залежний протеоліз • negative regulation of myotube differentiation • negative regulation of insulin-like growth factor receptor signaling pathway • muscle system process • protein homooligomerization • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • екзоцитоз Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	493829	434246
Ensembl	ENSG00000177238	ENSMUSG00000042828
UniProt	Q6ZMU5	Q1XH17
RefSeq (мРНК)	NM_001008274	NM_001079932
RefSeq (білок)	NP_001008275	NP_001073401
Локус (UCSC)	Хр. 16: 31.21 – 31.23 Mb	Хр. 7: 127.6 – 127.61 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TRIM72 (англ. Tripartite motif containing 72) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 16-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 477 амінокислот, а молекулярна маса — 52 731.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSAAPGLLHQ		ELSCPLCLQL		FDAPVTAECG		HSFCRACLGR		VAGEPAADGT
VLCPCCQAPT		RPQALSTNLQ		LARLVEGLAQ		VPQGHCEEHL		DPLSIYCEQD
RALVCGVCAS		LGSHRGHRLL		PAAEAHARLK		TQLPQQKLQL		QEACMRKEKS
VAVLEHQLVE		VEETVRQFRG		AVGEQLGKMR		VFLAALEGSL		DREAERVRGE
AGVALRRELG		SLNSYLEQLR		QMEKVLEEVA		DKPQTEFLMK		YCLVTSRLQK
ILAESPPPAR		LDIQLPIISD		DFKFQVWRKM		FRALMPALEE		LTFDPSSAHP
SLVVSSSGRR		VECSEQKAPP		AGEDPRQFDK		AVAVVAHQQL		SEGEHYWEVD
VGDKPRWALG		VIAAEAPRRG		RLHAVPSQGL		WLLGLREGKI		LEAHVEAKEP
RALRSPERRP		TRIGLYLSFG		DGVLSFYDAS		DADALVPLFA		FHERLPRPVY
PFFDVCWHDK		GKNAQPLLLV		GPEGAEA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, екзоцитоз, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, цитоплазматичних везикулах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Kohr M.J., Evangelista A.M., Ferlito M., Steenbergen C., Murphy E. (2014). S-nitrosylation of TRIM72 at cysteine 144 is critical for protection against oxidation-induced protein degradation and cell death. J. Mol. Cell. Cardiol. 69: 67—74. PMID 24487118 DOI:10.1016/j.yjmcc.2014.01.010

Див. також

• Хромосома 16