TRIM9

TRIM9
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2DB8
Ідентифікатори
Символи	TRIM9, RNF91, SPRING, tripartite motif containing 9
Зовнішні ІД	OMIM: 606555 MGI: 2137354 HomoloGene: 9045 GeneCards: TRIM9
Онтологія гена Молекулярна функція • зв'язування з іоном металу • zinc ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein homodimerization activity • transferase activity • protein domain specific binding • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • SNARE binding Клітинна компонента • цитоплазма • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • міжклітинні контакти • дендрит (нейробіологія) • cell projection • синапс • цитоскелет • Синаптичні бульбашки • внутрішньоклітинний • гіалоплазма • presynaptic cytosol Біологічний процес • negative regulation of calcium ion-dependent exocytosis • Убіквітин-залежний протеоліз • negative regulation of SNARE complex assembly • synaptic vesicle exocytosis • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	114088	94090
Ensembl	ENSG00000100505	ENSMUSG00000021071
UniProt	Q9C026	Q8C7M3
RefSeq (мРНК)	NM_015163 NM_052978	NM_001110202 NM_001110203 NM_001286386 NM_001286387 NM_001286388 NM_053167
RefSeq (білок)	NP_055978 NP_443210	NP_001103672 NP_001103673 NP_001273315 NP_001273316 NP_001273317 NP_444397 NP_001392290 NP_001392291 NP_001392292 NP_001392293 NP_001392294 NP_001392295 NP_001392296 NP_001392297 NP_001392298 NP_001392299 NP_001392300 NP_001392301 NP_001392302 NP_001392303 NP_001392304 NP_001392305 NP_001392306 NP_001392307 NP_001392308 NP_001392309 NP_001392310 NP_001392311 NP_001392312 NP_001392313 NP_001392314 NP_001392315 NP_001392316
Локус (UCSC)	Хр. 14: 50.98 – 51.1 Mb	Хр. 12: 70.29 – 70.39 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TRIM9 (англ. Tripartite motif containing 9) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 710 амінокислот, а молекулярна маса — 79 177.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEEMEEELKC		PVCGSFYREP		IILPCSHNLC		QACARNILVQ		TPESESPQSH
RAAGSGVSDY		DYLDLDKMSL		YSEADSGYGS		YGGFASAPTT		PCQKSPNGVR
VFPPAMPPPA		THLSPALAPV		PRNSCITCPQ		CHRSLILDDR		GLRGFPKNRV
LEGVIDRYQQ		SKAAALKCQL		CEKAPKEATV		MCEQCDVFYC		DPCRLRCHPP
RGPLAKHRLV		PPAQGRVSRR		LSPRKVSTCT		DHELENHSMY		CVQCKMPVCY
QCLEEGKHSS		HEVKALGAMW		KLHKSQLSQA		LNGLSDRAKE		AKEFLVQLRN
MVQQIQENSV		EFEACLVAQC		DALIDALNRR		KAQLLARVNK		EHEHKLKVVR
DQISHCTVKL		RQTTGLMEYC		LEVIKENDPS		GFLQISDALI		RRVHLTEDQW
GKGTLTPRMT		TDFDLSLDNS		PLLQSIHQLD		FVQVKASSPV		PATPILQLEE
CCTHNNSATL		SWKQPPLSTV		PADGYILELD		DGNGGQFREV		YVGKETMCTV
DGLHFNSTYN		ARVKAFNKTG		VSPYSKTLVL		QTSEVAWFAF		DPGSAHSDII
LSNDNLTVTC		SSYDDRVVLG		KTGFSKGIHY		WELTVDRYDN		HPDPAFGVAR
MDVMKDVMLG		KDDKAWAMYV		DNNRSWFMHN		NSHTNRTEGG		ITKGATIGVL
LDLNRKNLTF		FINDEQQGPI		AFDNVEGLFF		PAVSLNRNVQ		VTLHTGLPVP
DFYSSRASIA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, клітинних контактах, клітинних відростках, цитоплазматичних везикулах, синапсах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 14