TTBK1

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
Перейти до навігації Перейти до пошуку
TTBK1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи TTBK1, BDTK, tau tubulin kinase 1
Зовнішні ІД MGI: 2147036 HomoloGene: 50342 GeneCards: TTBK1
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_032538
NM_001162864
NM_175351
RefSeq (білок)
NP_115927
NP_001156336
Локус (UCSC) Хр. 6: 43.24 – 43.29 Mb Хр. 17: 46.75 – 46.8 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

TTBK1 (англ. Tau tubulin kinase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 321 амінокислот, а молекулярна маса — 142 737[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MQCLAAALKDETNMSGGGEQADILPANYVVKDRWKVLKKIGGGGFGEIYE
AMDLLTRENVALKVESAQQPKQVLKMEVAVLKKLQGKDHVCRFIGCGRNE
KFNYVVMQLQGRNLADLRRSQPRGTFTLSTTLRLGKQILESIEAIHSVGF
LHRDIKPSNFAMGRLPSTYRKCYMLDFGLARQYTNTTGDVRPPRNVAGFR
GTVRYASVNAHKNREMGRHDDLWSLFYMLVEFAVGQLPWRKIKDKEQVGM
IKEKYEHRMLLKHMPSEFHLFLDHIASLDYFTKPDYQLIMSVFENSMKER
GIAENEAFDWEKAGTDALLSTSTSTPPQQNTRQTAAMFGVVNVTPVPGDL
LRENTEDVLQGEHLSDQENAPPILPGRPSEGLGPSPHLVPHPGGPEAEVW
EETDVNRNKLRINIGKSPCVEEEQSRGMGVPSSPVRAPPDSPTTPVRSLR
YRRVNSPESERLSTADGRVELPERRSRMDLPGSPSRQACSSQPAQMLSVD
TGHADRQASGRMDVSASVEQEALSNAFRSVPLAEEEDFDSKEWVIIDKET
ELKDFPPGAEPSTSGTTDEEPEELRPLPEEGEERRRLGAEPTVRPRGRSM
QALAEEDLQHLPPQPLPPQLSQGDGRSETSQPPTPGSPSHSPLHSGPRPR
RRESDPTGPQRQVFSVAPPFEVNGLPRAVPLSLPYQDFKRDLSDYRERAR
LLNRVRRVGFSHMLLTTPQVPLAPVQPQANGKEEEEEEEEDEEEEEEDEE
EEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEAAAAVALGEVLGPRSGSSSEGSERSTDRS
QEGAPSTLLADDQKESRGRASMADGDLEPEEGSKTLVLVSPGDMKKSPVT
AELAPDPDLGTLAALTPQHERPQPTGSQLDVSEPGTLSSVLKSEPKPPGP
GAGLGAGTVTTGVGGVAVTSSPFTKVERTFVHIAEKTHLNVMSSGGQALR
SEEFSAGGELGLELASDGGAVEEGARAPLENGLALSGLNGAEIEGSALSG
APRETPSEMATNSLPNGPALADGPAPVSPLEPSPEKVATISPRRHAMPGS
RPRSRIPVLLSEEDTGSEPSGSLSAKERWSKRARPQQDLARLVMEKRQGR
LLLRLASGASSSSSEEQRRASETLSGTGSEEDTPASEPAAALPRKSGRAA
ATRSRIPRPIGLRMPMPVAAQQPASRSHGAAPALDTAITSRLQLQTPPGS
ATAADLRPKQPPGRGLGPGRAQAGARPPAPRSPRLPASTSAARNASASPR
SQSLSRRESPSPSHQARPGVPPPRGVPPARAQPDGTPSPGGSKKGPRGKL
QAQRATTKGRAGGAEGRAGAR

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, серин/треонінових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі.

Література

[ред. | ред. код]
  • Sato S., Cerny R.L., Buescher J.L., Ikezu T. (2006). Tau-tubulin kinase 1 (TTBK1), a neuron-specific tau kinase candidate, is involved in tau phosphorylation and aggregation. J. Neurochem. 98: 1573—1584. PMID 16923168 DOI:10.1111/j.1471-4159.2006.04059.x
  • Nagase T., Nakayama M., Nakajima D., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XX. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 8: 85—95. PMID 11347906 DOI:10.1093/dnares/8.2.85
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

[ред. | ред. код]
  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:19140 (англ.) . Архів оригіналу за 13 березня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.
  4. UniProt, Q5TCY1 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

[ред. | ред. код]